Согласно проекту превращения реки в канал, болото, из которого она вытекала, осушили, саму Глухую речку углубили, соединили с Мойкой и на участке от Конюшенной площади до Невского проспекта, насколько это было возможно, выпрямили. На остальном своем протяжении русло канала оставили узким и извилистым, сохранив тем самым его удивительную природную живописность, до сих пор поражающую живое воображение художников и поэтов.
С 1767 года река стала называться каналом, которому дали официальное название — Екатерининский, по имени императрицы Екатерины II, в царствование которой он был прорыт. Впрочем, в народе вот уже более двухсот лет для него существуют другие, более просторечные имена: «Канава», «Екатерининская канава», а то и просто «Катькина канава».
В 1923 году Екатерининский канал переименовали в канал имени Писателя Грибоедова. Именно так. Чтобы не путали с другим Грибоедовым. В то время в городе бытовала героическая легенда о неком революционере Грибоедове, павшем в боях за светлое будущее всего человечества. За это якобы его имя обессмертили в городской топонимике. Так что уточнение принадлежности автора «Горя от ума» Александра Сергеевича Грибоедова к писательскому цеху могло оказаться вовсе не лишним. Только в самом конце 1920-х годов за каналом закрепился окончательный вариант названия: канал Грибоедова.
В середине XIX века возникла мистическая связь Екатерининского канала с судьбой императора Александра II. Для тогдашнего Петербурга это не было секретом. Все хорошо знали о сложных отношениях в царской семье. Официальная любовница императора Екатерина Михайловна Долгорукая еще при жизни законной супруги Александра II императрицы Марии Александровны претендовала на роль первой дамы государства. Она родила Александру II трех детей: сына и двух дочерей. А когда императрица Мария Александровна скончалась, то в том же 1880 году состоялся обряд венчания Александра II и княгини Екатерины Михайловны Долгорукой.
Назревал династический скандал. Злые языки уверяли, что очень скоро состоится коронация новой императрицы. Будто бы уже был заказан даже вензель — «Е III», то есть «Екатерина III». Случиться этому помешала трагическая гибель императора в марте 1881 года. Городской фольклор тут же связал это событие с Екатериной Михайловной. По Петербургу молниеносно распространилась крылатая фраза: «Александр II влюбился в Екатерину Долгорукую и погиб на Екатерининском канале». Напомним, что существует легенда о давней родовой вражде между старинными русскими домами Романовых и Долгоруких. Будто бы еще в XVII веке некий монах предсказывал гибель всех Романовых, которые решатся связать свою судьбу с Долгорукими. Вспоминали о неожиданной болезни и смерти юного императора Петра II прямо накануне собственной свадьбы. Его невестой была тоже Екатерина и тоже Долгорукая. И вот теперь очередная трагедия. Было от чего задуматься.
В 1869 году в Государственную думу был внесен неожиданный проект инженера Н. И. Мюссарда и архитектора Н. Л. Бенуа. Они предлагали засыпать Екатерининский канал и по его руслу проложить так называемый «проспект Славы». Правда, после трагической гибели Александра II в 1881 году проспект предложили переименовать в Александровский и придать ему мемориальный характер. Проспект должен был стать украшением Петербурга. На всем его протяжении предполагалось соорудить прогулочные бульвары с фонтанами и скамейками для отдыха и установить бюсты всех русских правителей — великих князей, царей и императоров от Рюрика до Александра II. При этом все мосты предлагалось или уничтожить, или перенести на новые места.
В качестве аргументов в пользу засыпки канала авторы проекта утверждали, что вода в канале застойна, «дурно пахнет канализацией, а это неприятно и вредно, поскольку из-за этого распространяются болезни». Кроме того, канал будто бы мелок, узок и имеет слабое течение. Проект был отвергнут.
В 1893 году Городской думой был отвергнут как требующий «разгрома центральной части города и уничтожения векового ценного сооружения» и другой проект, поданный камер-юнкером Р. К. фон Гартманом. Он предложил засыпать Екатерининский канал и проложить по его руслу скоростную железную дорогу с главной станцией на месте Банковского моста. Дорога должна была соединить три вокзала: Балтийский, Варшавский и Николаевский.
Еще раз к идее уничтожения Екатерининского канала попытались вернуться в начале XX века, накануне Первой мировой войны. Новый проект активно поддерживал один из авторитетнейших архитекторов Петербурга П. Ю. Сюзор. Но и на этот раз из-за недостатка средств в бюджете города от проекта отказались. Затем в истории России началась новая эпоха, и о проектах превращения Екатерининского канала в проспект Александра II забыли. Имя Александра II, одного из самых знаменитых персонажей русской истории, в новой России стало неактуальным. Память о нем старались вытравить из совокупной памяти поколений.