С рубежом 1,9 - 1 млрд. лет (границей раннего и позднего афебия) в серии Ганфлинт (южная часть шт. Онтарио, США) связаны одни из наиболее примечательных находок. Помимо строматолитов здесь известны десятки родов, по-видимому, фитопланктонных организмов шарообразной, звездчатой и нитчатой форм, причем последние со следами перегородок (клеток?). В составе этой биоты идентифицируются цианофиты, бактерии и, видимо, грибы. В СССР примерно такое же стратиграфическое положение занимает ятулий Карелии. Возраст ятулийской седиментации около 2 млрд. лет или несколько меньше. Здесь встречаются богатейшие проявления жизнедеятельности водорослей - строматолиты. В углистых сланцах Шуньги обнаружен обильный фитопланктон. О микрофлоре позднего афебия или среднего протерозоя (1,9 - 0,1 - 1,6 - 0,1 млрд. лет) поступают разнообразные данные и из других районов мира (Канады, Гренландии и т. д.).
Исключительный интерес как биологический мегахрон представляет рифей. Ни одно из стратиграфических подразделений докембрия не характеризуется столь обширным распространением различных породообразующих строматолитов и микрофитолитов. Карбонатные фации этого возраста на всех континентах почти повсеместно содержат строматолитовые постройки. Наиболее значительные результаты стратиграфического и структурного изучения строматолитов были достигнуты в СССР, однако лишь недавно началось исследование самих организмов-строматолитообразователей.
Ряд исследователей подтвердили, что строматолитообразователи - это прокариоты, представленные чрезвычайно однообразными филаментами цианофитных, одноклеточными сфероидальными формами того же типа и значительно реже - бактериями. Морфологический консерватизм названных прокариот находится в совершенно очевидном противоречии с макроструктурным разнообразием строматолитовых построек и заставляет думать, что последние в большей мере имеют экологический, чем таксономический смысл. Все это должно резко ограничивать стратиграфическое значение строматолитов определенными фациями и крупными периодами (100 - 300 млн. лет) экологического выравнивания условий развития древних бассейнов.
В биологическом отношении рифей очень важен тем, что с ним, несомненно, связано развитие эвкариот. Датировать точно этот фундаментальный скачок в эволюционном процессе пока нельзя, по-видимому, он произошел не ранее начала рифея и не позднее рубежа между ранним и средним его этапами. Во всяком случае, в доломитах Бэк Спринг (шт. Калифорния, США) уже были обнаружены зеленые одноклеточные эвкариотные водоросли, возраст которых достигает 1,3 млрд. лет. Одна из богатейших флор конца среднего рифея существовала в Сибири. В мироедихинской свите Туруханского района и в нижней части лахандинской серии Учуро-Майского района обнаружены разнообразные одноклеточные водоросли прекрасной сохранности, в том числе формы с резко обособленным внутренним телом, сходным с ядром, и с признаками различных стадий амитоза и клеточного деления, многочисленные цепочечные агрегаты «ядерных» клеток и массовые скопления водорослевых филаментов. Здесь же открыты формы, морфологически идентичные или близкие современным Phycomycetes, также содержащие темное внутреннее тело. Подлинной сенсацией стало в свое время открытие позднерифейской микрофлоры в формации Биттер Спрингс Центральной Австралии (возраст около 900 млн. лет). Эта микрофлора стала важнейшим объектом интерпретации древнейших эвкариот, среди которых были идентифицированы разнообразные зеленые водоросли (такие, как близкие к Nucellosphaeridium - Caryosphaeroldes, Clenobotrydion и другие), возможно, красные и пиррофитовые водоросли (Zosterosphaera), а также очень обильные осциллаторные прокариотные цианофиты.
На Сибирской платформе в среднем и верхнем рифее в последние годы встречены окремненные строматолитовые породы, в которых в изобилии находят разнообразные микрофоссилии.
По-прежнему остро дискуссионной проблемой остается происхождение многоклеточных растений и многоклеточных животных. Но независимо от того, какую гипотезу происхождения многоклеточных организмов мы примем и будем ли считать, что обе группы произошли независимо и одновременно или разделению этих царств предшествовал период симбиогенетического развития, три заключения подкреплены сейчас хорошо обоснованными фактами: 1) появление макроскопических органических форм не ранее позднего рифея (900 - 1000 млн. лет); 2) более или менее близкое по времени (в пределах позднего рифея и особенно венда) появление бентосных Metaphyta с необызвествленным слоевищем и следов жизнедеятельности беспозвоночных, а позднее - самих отпечатков и остатков Metazoa; 3) достаточно высокий уровень содержания свободного кислорода в атмосфере того времени, так как только переход к кислородному дыханию мог стать важнейшим энергетическим импульсом в развитии всех жизнеобеспечивающих систем многоклеточных организмов. Этот скачок, который характеризовался переходом от брожения к окислению, известный под названием «эффекта Пастера», произошел не в начале кембрийского периода, как полагали еще совсем недавно, а по меньшей мере на 400 млн. лет раньше, т. е. на границе среднего и позднего рифея. Именно в позднем рифее, а возможно, и несколько ранее, произошли события, пока в значительной степени скрытые от нас, результатом которых явилась первая яркая вспышка и дальнейший подлинный расцвет вендской флоры и фауны.