Одновременно между Германией и СССР был подписан секретный дополнительный протокол, в соответствии с которым в сферу интересов Советского Союза попадали территории, ранее принадлежавшие царской России: Финляндия, Эстония, Латвия, восточная часть Польши, Бессарабия, а позднее и Литва.
Не подлежит сомнению, что заключенный договор с Германией о ненападении на какой-то срок обезопасил Советский Союз и позволил выиграть время для повышения обороноспособности страны и укрепления армии. И в то же время проваленные трехсторонние переговоры и заключение этого договора подтолкнули Германию к активным боевым действиям. 1 сентября 1939 года германские войска без объявления войны вторглись на территорию Польши. Великобритания и Франция, будучи союзниками Польши, 3 сентября объявили Германии войну. Так началась Вторая мировая война, принесшая неисчислимые беды и страдания всем народам Европы.
К войне с фашистской Германией армия Польши оказалась неподготовленной: не была закончена мобилизация; боевая техника была малочисленной и в качественном отношении значительно уступала немецкой; отсутствовали сильные укрепленные сооружения на западной границе страны. Польский военно-морской флот имел в своем составе только 4 эсминца, 2 миноносца, 5 подводных лодок, 2 канонерские лодки, минный заградитель, 6 тральщиков, бригаду морской пехоты и небольшой отряд морской авиации.
Несмотря на довольно упорное сопротивление польских войск в некоторых районах, немецко-фашистские войска ударными группировками развернули стремительное наступление в глубь страны. Под натиском превосходящих сил польские части отходили по всему фронту, неся большие потери в личном составе и боевой технике. Обойдя Варшаву, германские войска к 17 сентября вышли на линию Августов, Сокулка, Гайнувка, Кобрин, Брест, западнее Львова. Большая часть польских войск оказалась в окружении. Правительство страны еще 6 сентября покинуло Варшаву и перебралось в Люблин, а 16 сентября уже находилось в Румынии. Не оказали существенной помощи и войска союзников Польши.
Неудачные боевые действия польской армии, быстрое продвижение германских войск на восток создали опасную угрозу выхода их механизированных соединений к западным границам Советского Союза. Конечно, в такой ситуации советскому правительству было совсем небезразлично, на каком расстоянии от Минска и Киева остановятся войска Германии, и остановятся ли они.
Начавшиеся боевые действия в Польше потребовали от советского руководства принять дополнительные меры по укреплению обороноспособности своей страны. 1 сентября 1939 года Верховный Совет СССР принял Закон о всеобщей воинской обязанности, в котором говорилось, что защита социалистического Отечества является почетной обязанностью и священным долгом каждого советского гражданина.
Законом отменялись все классовые ограничения в военной службе, устанавливался новый порядок ее прохождения. В Красную Армию призывались все граждане СССР, которым исполнилось 19 лет, а окончившие среднюю школу — в 18 лет. Устанавливались и новые сроки службы для красноармейского и младшего начальствующего состава (в сухопутных войсках и авиации — 3 года).
Еще раньше (в мае 1939 года) срок службы на флоте был доведен до 5 лет, в частях связи и береговой артиллерии до 4, в специальных частях — до 3 лет. Это позволило значительно увеличить численность РККА и РККФ.
Летом 1939 года Совет Народных Комиссаров СССР утвердил новую организационную структуру Наркомата ВМФ.
Нарком утвердил и новое «Положение об организации и работе Главного морского штаба РКВМФ», в котором было четко определено, что он является органом боевого управления народного комиссара ВМФ по подготовке и использованию сил флота для обеспечения морской обороны СССР.
На Главный морской штаб возлагались следующие задачи:
— разработка и согласование с Генеральным штабом РККА мероприятий по совместным действиям РККА и. РКВМФ;
— разработка оперативных планов РКВМФ и вопросов оперативного использования флотов, флотилий и органов тыла по обороне СССР;
— разработка организационной структуры и штатов флота по мирному и военному времени;
— разработка вопросов и схемы организационно-мобилизационного развертывания сил и средств флота;