Вскоре в Костроме состоялось расширенное заседание Совета рабочих депутатов, Совета крестьянских депутатов, КГОКОБа и других общественных организаций. И «левые» и «умеренные» приняли постановление: на должность руководителя военной комиссии, которую занимал В. Н. Лебедев, избрать прапорщика 88-го пехотного запасного полка товарища С. Ф. Фоминского, а бывшего руководителя военной комиссии товарища Лебедева избрать губернским комиссаром Временного правительства и поручить ему возглавить работу КГОКОБа.
Приложив все усилия к сохранению дисциплины в гарнизоне, порядка в губернии, сумев избежать «избиения» офицеров и бывших полицейских, Лебедев понял, что не в состоянии справиться со всеми теми проблемами, которые легли на его плечи. Ему приходилось круглосуточно контролировать всю хозяйственную жизнь в городе и уездах, политическую, общественную, военную обстановку, положение с продовольственным снабжением. Особого внимания требовали проблемы роста преступности, антисанитарии, нужды военных госпиталей (число которых постоянно росло), деятельности национальных меньшинств, культуры, образования, церкви. Ему остро не хватало знаний, опыта, а подчас и воли в принятии решений.
Спустя два месяца после избрания В. Н. Лебедев попросил отпустить его с поста губернского комиссара, чтобы вернуться к своей привычной военной службе.
В начале мая он передал свои полномочия присяжному поверенному, одному из лидеров костромских эсеров Н. А. Козлову.
Октябрьскую революцию В. Н. Лебедев не принял, но и противостоять ей не решился. Новый поворот в его жизни произошел в 1918 году, когда, откликнувшись на призыв генерала А. Брусилова защитить родину от польских интервентов, он, как и тысячи других офицеров, покинувших на тот момент части, пошел добровольцем в действующую, теперь уже Красную, армию. В числе первых ополченцев попал на западный фронт. В тяжелых боях среди украинских степей был ранен и направлен на лечение в тыл. Сменив несколько госпиталей, вернулся в Кострому. Политика его по-прежнему не интересовала, он пытался найти работу, чтобы прокормить семью. По всей видимости, в это время Лебедев не раз получал предложения примкнуть к контрреволюционным офицерским кружкам, однако никаких сведений о том, что он принял эти предложения, нет.
Тем не менее, костромская ЧК арестовала В. Н. Лебедева по подозрению в принадлежности к офицерской организации — Союзу спасения Родины и связях с Всероссийским национальным центром. За недоказанностью обвинения В. Н. Лебедева освободили. После нескольких месяцев, проведенных в заключении, бывший губернский комиссар Временного правительства оказался вновь без работы.
Тяжелое экономическое состояние семьи и болезни заставили В. Н. Лебедева покинуть Кострому и уехать домой, к своим родственникам, в Кологривский уезд.
В 1922 году семья вернулась в Кострому. Бывшие сослуживцы Лебедева помогли ему устроится на курсы красных командиров. Вскоре он возглавил Пехотные курсы и 1-й территориальный отряд Красной армии, потом работал в губвоенкомате. Спустя год В. Н. Лебедев был демобилизован из армии по состоянию здоровья. Работал в различных учреждениях: агентом по закупке продовольствия, контроллером зерносклада, инспектором санитарной станции и т. д.
1927 год стал для В. Н. Лебедева годом испытаний. Его арестовали по подозрению в принадлежности к подпольному Обществу Белого Орла.
Несколько месяцев, пока шло предварительное следствие, он провел в заключении в следственном изоляторе. В канун 10-летия Октябрьской революции, наряду со многими другими заключенными, ожидавшими суда, был амнистирован. Следующие 5 лет — время относительного спокойствия в жизни В. Н. Лебедева. Отношение власти к бывшим офицерам — военным специалистам несколько улучшилось. Многие из них вернулись на действительную военную службу, поступили на работу в полувоенные организации.
Опыт и знания В. Н. Лебедева оказались востребованы на преподавательской работе в Костромской школе милиции, где он работал с ноября 1929 года. В 1930 году он стал совмещать эту работу с преподаванием на курсах противохимической обороны (ПХО), а чуть позже, из-за крайней нужды в деньгах, устроился подрабатывать секретарем в музыкальную школу.