Афанасий наблюдал, как в священный город стекались тысячи паломников, они осыпали главную статую Шивы цветами. Афанасия поразило, что хоть паломники и не носили одежды, на них были украшения из жемчуга и золота.
К лету 1472 года Афанасий снова вернулся в Бидар. Его путешествие длилось уже четыре долгих года. Он серьёзно задумался о возвращении домой. Афанасия расстраивало, что он живёт среди мусульман и индийцев и христианские праздники не празднует. Его православные книги погибли под Астраханью, на разграбленном татарами корабле. И чтобы точно определить, когда наступит праздник Пасха, Афанасий принялся изучать звёздное небо, что свидетельствует о его познаниях в астрономии. «В Бидаре Великом, в Бесерменской Индии, в Великую ночь на Великий день смотрел я, как Плеяды и Орион в зорю вошли, а Большая Медведица головою стояла на восток», – записал он.
Афанасий решил возвращаться на Русь тем же путём – через Персию. Но персидские купцы сообщили ему, что в стране начались междоусобные войны. «Пути не знаю – куда идти мне из Индостана: из Ормуза на Хорасан пути нет, и на Чаготай пути нет, ни в Багдад пути нет, ни на Бахрейн пути нет, ни на Йезд пути нет, ни в Аравию пути нет. Повсюду усобица князей повыбивала».
Ещё на год пришлось задержаться Афанасию в Индии в надежде, что путь домой станет безопасным. Странствия привели его в индийский город Гулбáрга, который находился в ста километрах к юго-западу от Бидара. В то время в Гулбаргу прибыл мусульманский султан с войском после неудачного военного похода против сильной Виджаянагарской империи, занимавшей весь юг Индии. Афанасий описал военную кампанию и её результаты. Султан планировал взять приступом столицу империи – Виджаянагар. Это был очень большой город, защищённый тремя рвами и рекой с одной стороны и густыми джунглями с другой. Целый месяц стояла армия султана под городом, а взять не смогла. Многие воины умирали от жажды. Хоть река была совсем близко, подойти к ней не позволяли защитники города. Тогда султан со злости захватил другой город, поменьше. Султан остался недоволен походом – «людей много погибло, и казны много поистратили».
Из Гулбарги Афанасий отправился в Каллур, где добывался драгоценный камень сердолик. Идея купить драгоценных камней на продажу всё ещё казалась ему привлекательной. «В Каллуре родится сердолик, – писал он, – и тут его обрабатывают, и отсюда по всему свету развозят. В Каллуре триста алмазников живут (оружье украшают). Пробыл я тут пять месяцев».
После этого Афанасий Никитин прибыл в портовый город Дабхол и за две золотые монеты сел на корабль, направляющийся обратно в Персию, в Ормуз. Произошло это в начале 1474 года.
И вновь Афанасий поплыл через «море Индийское», рассчитывая быстро добраться до Ормуза. Однако удача отвернулась от мореплавателей. Бури и ветра угнали корабль далеко на юго-запад. Целый месяц плавал Афанасий в открытом море, «не видя ничего», и очутился у берегов Африки, в Эфиопии. Корабль тут же окружили местные разбойники на лодках, требуя выкупа. Пришлось откупаться «рисом, перцем да хлебом». Как назло, пять дней не было ветра, корабль не мог отплыть от берега, каждый день возвращались разбойники за данью. «Много раздали рису, да перцу, да хлеба эфиопам. И они судна не пограбили», – написал Афанасий. Наконец поднялся ветер, и корабль смог отплыть. Три недели плыли они до Ормуза и добрались туда весной 1474 года. Четыре года продолжалось его путешествие по индийской земле.
В Ормузе застали его тревожные новости: в Персии назревала новая война. Правитель северо-западных земель Узун-Хасан готовился к решающей схватке с турецким султаном Мехмедом II, завоевателем Константинополя. Афанасий торопился на север, чтобы успеть попасть домой до военных действий. Однако ему пришлось ждать двадцать дней, прежде чем он смог присоединиться к торговому каравану, направляющемуся в персидский город Шираз. Семь дней Афанасий провёл в Ширазе, пока не присо единился к другому каравану, с которым добрался до города Йезд на севере Персии. Уже второй раз Афанасий путешествовал этой дорогой, но в предвоенное время это стало ещё опаснее.