Первым его шагом была организация клинической современной лаборатории. В первое время С. П. Боткин сам руководил занятиями в ней. Основная масса работ клиники С. П. Боткина вышла из этой лаборатории. В ней с 1878 года, в течение 10 лет, играл руководящую роль знаменитый русский физиолог Иван Петрович Павлов, который провел здесь свои выдающиеся исследования и написал диссертацию о сердечных нервах. Здесь же И. П. Павловым и Стольниковым для изучения влияния сердечных средств была придумана методика с искусственным кругом кровообращения. Эта методика являлась прообразом того, что через много лет было предложено английским физиологом Старлингом в виде его сердечно — легочного препарата.
В 1884 году С. П. Боткин открыл при клинике и бактериологическую лабораторию.
Сергей Петрович в обращении к студентам на вступительной лекции осеннего семестра 1862 года говорил: «Чтобы избавить больного от случайностей, а себя от личных угрызений совести и принести истинную пользу человечеству, неизбежный для этого путь есть научный… а потому в клинике вы должны научиться рациональной практической медицине, которая изучает больного человека и отыскивает средства к изучению или облегчению его страданий… Больной есть предмет вашего научного исследования. Собрав сумму анатомических, физиологических и патологических фактов, вы делаете заключение, представляющее уже не диагностику болезни, а диагностику больного. Собирая факты, вы получите не только патологические явления того или другого органа, на основании которых дадите название болезни, но вместе с этим увидите состояние всех остальных органов, находящихся в более или менее тесной связи с заболеванием. Вот эта‑то индивидуализация каждого случая, основанная на научных данных, и составляет задачу клинической медицины и вместе с тем самое тверже основание лечения, направленного не против болезни, а против страдания больного».
Медицина как знание, как искусство врачевания существует века, но медицина как наука, как естествознание возникла, в сущности, лишь в XIX веке; одним из ее основоположников и был Сергей Петрович Боткин.
С. П. Боткин в 1875 году, задолго до английского физиолога Баркрофта, раскрыл роль селезенки как депо — органа в системе кровообращения. В своих лекциях по поводу многих заболеваний Сергей Петрович сделал предположение о существовании в головном мозге особых центров — теплового, сахарного, потового, кроветворного и других, что в настоящее время считается аксиомой.
С. П. Боткин был прекрасным преподавателем. Среди учеников С. П. Боткина насчитывается много блестящих имен; все русские университеты и академии имели среди своих профессоров учеников Сергея Петровича.
С. П. Боткин воспитал поколение врачей, которые ставили во главу угла не свои личные интересы, а интересы общества, которые самоотверженно служили русскому народу.
Сергей Петрович Боткин положил начало русской медицинской литературе; в течение многих лет (1869–1889) он редактировал и на собственные средства издавал «Архив клиники внутренних болезней», под его редакцией выходила «Еженедельная клиническая газета» (1881–1889).
Сергей Петрович Боткин умер 24 декабря 1889 года в возрасте 57 лет, в самом расцвете своей научной деятельности. «Вся обширная деятельность этого в высшей степени замечательного человека на поприще медицинского образования в России, деятельность как ученого, как учителя и профессора-клинициста, как врача и общественного деятеля была так велика и многостороння, что имя его, будучи одним из наиболее блестящих медицинских имен для современников, навсегда останется и для потомства в высшей степени почетным и вечно памятным в истории развития русской медицинской науки» (профессор Л. В. Попов).
Основные события жизни
1850 г. — С. П. Боткин поступил на медицинский факультет Московского университета.
1855 г. — С. П. Боткин по окончании медицинского факультета отправился в Крым на театр военных действий.
1856 г. — С. П. Боткин выехал за границу.
1860 г. — С. II. Боткин получает место адъюнкта по терапии в петербургской Медико — хирургической академии.
1875 г. — С. П. Боткин задолго до английского физиолога Баркрофта раскрыл роль селезенки как депо — органа в системе кровообращения.
1884 г. — С. П. Боткин открыл при клинике бактериологическую лабораторию.