Но, несмотря на это, брат Амадея Филипп при поддержке других братьев Джакомо и Луиджи постоянно пытался его устранить. Они даже подняли восстание и заключили герцога в тюрьму, но его спас тесть, король Франции, и освободил из заточения. После этого Амадей IX созвал генеральный совет, на котором он объявил о своем желании оставить герцогский престол и вести обычную жизнь простого человека.
Амадей IX назначил своим наследником сына Филиберта, а его регентшей – жену Иоланду. После этого он перебрался в свой любимый город Верчелли и посвятил жизнь помощи беднякам. Амадей был глубоко верующим человеком, он вел скромный и аскетичный образ жизни, за что его очень любили и почитали простые люди. Герцог Савойский был горячим сторонником нового крестового похода против турок за освобождение Константинополя, но сам лично не мог в нем участвовать по состоянию здоровья.
Амадей IX скончался 30 марта 1472 года в возрасте 37 лет и был похоронен в соборе Верчелли. Впоследствии его потомок Морис Савойский вместе с кардиналом Роберто Беллармино сделали все возможное для его беатификации, которую объявил римский папа Иннокентий IX в 1678 году. После смерти Амадея IX наступает период, когда герцоги Савойские умирали один за другим.
Его сын Филиберт I Савойский по прозвищу Охотник родился в 1465 году в Шамбери. Мальчик становится герцогом в возрасте всего семи лет под регентством своей матери Иоланды Валуа. Но регентство Иоланды оспаривает брат Амадея IX Филипп по прозвищу Безземельный, из-за того, что у него не было своих владений. Это был жестокий человек без морали и принципов. В возрасте 18 лет он убивает двух приближенных своего отца Людовика с одобрения французского короля Людовика XI. С тех пор он всегда был на стороне монарха.
После смерти брата Амадея IX Филипп Безземельный пытался с помощью войск короля отвоевать право на свое регентство, но Иоланда обратилась за помощью к герцогу Бургундскому, и Филипп проиграл. Аристократы Во и Валезе воспользовались этим, увидев, что армия Савойя слишком слабая, и отвоевали свою независимость. После этого герцогство попадает под контроль Франции. Когда Филиберту исполнилось 11 лет, его женили на четырехлетней двоюродной сестре Бьянке Марии Сфорца, дочери Галеаццо Марии Сфорца и Боны Савойской. Этот брак никогда не был консумирован из-за того, что Филиберт Савойский внезапно скончался в возрасте 17 лет. Герцогство перешло по наследству его брату Карлу. Бьянка Мария Сфорца впоследствии вышла замуж за императора Священной Римской империи Максимилиана I Габсбурга, она была матерью Филиппа I Красивого и бабушкой легендарного императора Карла V.
Брат Филиберта I Карл тоже прожил недолго, всего 21 год. В возрасте 14 лет он становится герцогом Савойским и женится на Бьянке Монферрато, дочери маркиза Вильгельма VIII Палеолога. У них родилось двое детей: дочь Иоланда, которая прожила 12 лет, и сын Карл Иоанн Амадей. Несмотря на юный возраст, Карл был очень твердым, решительным и воинственным подростком. За семь лет правления ему удалось навести порядок в Пьемонте, где бесчинствовали местные бароны и феодалы. А также приобрести права на королевство Кипра, Иерусалима и Армянскую Киликию у своей тети Шарлотты Кипрской, которой он выплачивал взамен солидную пенсию.
Шарлотта потеряла права на Кипр еще в 1464 году, после смерти своего единственного сына Уго. Но она до конца жизни этого не признавала. После смерти последней королевы Кипра Екатерины Корнер королевство перешло во власть Венецианской республики, а Карл Савойский остался лишь претендентом. Карл I скончался в 1490 году после банкета, который он организовал в честь победы над маркизом Салуццо. Смерть герцога наступила, предположительно, от отравления.
Его маленький сын Карл Иоанн Амадей становится герцогом Карлом II Савойским в возрасте двух лет под регентством своей матери Бьянки Монферрато. Когда король Карл VIII вторгается в Италию, Савойя были первыми, кто открыли ему ворота и пропустили через свои земли. Что еще могла сделать слабая женщина Бьянка Монферрато перед такой сильной, оснащенной пушками армией?
Но Карлу II не суждено было править герцогством. В 1496 году мальчик умирает нелепой смертью: он упал с собственной кровати и разбил голову. Маленький герцог Савойский не дожил даже до восьми лет, но именно при регентстве его матери город Турин становится постоянной резиденцией дома Савойя. После смерти Карла Иоанна Амадея обрывается ветвь Амадея IX Савойского и герцогство переходит по наследству Филиппу Безземельному, брату Амадея IX, деду Карла II. Наконец-то он добился своего.