Кроме того, в подчинении начальника НБО фрегаттен-капитана Рикгофа находилась группа по подготовке разведчиков-диверсантов для заброски в глубокий тыл Красной Армии, которой придавались самолеты Люфтваффе и группа по формированию легиона «Шварц Меер» (руководитель — лейтенант Буш). Так же Рикгоф также руководил работой с представителями различных северокавкавказских «национальных комитетов», которые проводили вербовку и набирали людей в легион «Шварц Меер».
Легион «Шварц Меер» («Черное море»), состоял из пятисот отборных головорезов, — предназначенное для противопартизанских и диверсионных действий. Этот легион которому советские контрразведчики присвоили условное наименование «Акулы», взаимодействовала с разведывательными отделами морских комендатур (во всех приморских городах Украины) и морской комендатурой Кавказа.
Абверкоманда НБО вела сбор информации о Черноморском флоте и Азовской флотилии, затем Дунайской флотилии, частях Красной армии на побережье Черного и Азовского морей. В период своего пребывания в Крыму НБО, так же участвовала в борьбе против партизан.
НБО собирала информацию через агентуру, забрасываемую в советский тыл, и путем опроса военнопленных, бывших военнослужащих ВМФ, и местных жителей, имевших отношение к военно-морскому и торговому флотам.
Агентура НБО вербовалась из военнопленных моряков в лагерях Крыма и из местных жителей на Северном Кавказе. Ее предварительное обучение велось в специальных лагерях в крымских поселках Тавель, Симеиз и Бешуй. Часть агентуры направлялась в Варшавскую разведшколу.
Постепенно НБО распространила свою разведывательно-подрывную активность на Северный Кавказ, собирая сведения о частях Северо-Кавказского фронта. В 1943 году создается разведшкола НБО для подготовки 600 агентов из членов «Северокавказского карачаевского комитета». Отдельные спецгруппы НБО обезвреживались в районе города Грозный, где им ставились разноплановые разведывательные задачи»
Охранным подразделение и одновременно спецназом НБО, являлся, так называемый «Казачий абтелунг» (казачий отряд) особого назначения, который возглавлял зондерфюрер Шалибалиев Иван Петрович, бывший белогвардейский полковник казачьих войск. Это подразделение НБО, было сформировано в декабре 1941 г. в посёлке Тавель под Симферополем. В июне — начале июля 1942, принимал участие в 3-м штурме Севастополя.
В январе — феврале 1942, одно из разведывательных подразделений НБО находилось в Таганроге, затем переехала в Мариуполь. В течение второй половины 1942, сотрудники этого подразделения органа вели опрос военнопленных и их вербовку в качестве агентов в лагерях для военнопленных в Мариуполе, Ростове-на-Дону и их окрестностях
Из Мариуполя агентура перебрасывала в тыл частей Красной Армии, действовавших на Азовском побережье и Кубани. Для этой цели, часть завербованных бывших советских военнопленных проходили подготовку в Крыму в Тавельской школе и её филиалах в Бешуе и Семеизе, другая часть агентуры проходила подготовку на конспиративных квартирах в Мариуполе. Наиболее подготовленным и пользующимся особым доверием агентам поручалось войти в доверие к органам советской разведки и добиться заброски в немецкий тыл.
В мае 1943, в Крыму в составе НБО, было сформировано отдельное контрпартизанское соединение «Легион Черного моря», численностью около 500 человек.
В конце октября 1943 года НБО переехала в Херсон, затем в Николаев, оттуда — в Одессу. В апреле 1944 года команда прибыла в румынский город Браилов (по другим данным в румынский город Галац), а в августе 1944 года — в окрестности Вены, где в октябре 1944, НБО была расформирована.
При эвакуации НБО из Одессы, оттуда в Кишинев было переведено свыше 500 агентов, не считая оставленных со спецзаданиями на освобожденной территории).
Следует признать высокую квалификацию агентуры НБО, поскольку в 1943–1945 годах Управлением контрразведки «СМЕРШ» ЧФ было выявлено всего 44 её агента, из которых 17 явились с повинной.
После эвакуации в Румынию НБО было переименовано в абверкоманду «Вайтланд». В период пребывания в Румынии, абверкоманда «Вайтланд», располагала головным постом в дунайском городе Рении, и через него вела переброску агентуры в тылы Красной Армии. После вступления советских войск в Румынии, в августе 1944, «Вайтланд» переместилась в окрестности Вены (городок Рамсдорф), где находилась до конца войны
По специфике своей деятельности немецкие морские спецслужбы, действовавшие на побережье Черного моря, и прежде всего НБО были одним из главных противников и следовательно объектов деятельности контрразведки Черноморского флота. В связи с этим, в феврале 1944 года в оккупированный немцами Николаев проникли два агента Управления контрразведки Черноморского флота, имевшие агентурные псевдонимы «Ястреб» и «Грозный».