Организация «Серые волки», к которой и принадлежит Агджа, продолжает существовать и в наши дни. В 2015 году, когда турецкими ВВС был сбит российский Су-24, катапультировавшийся экипаж был обстрелян с земли именно «серыми волками», один из которых сначала взял на себя вину за убийство командира экипажа, затем в суде, растеряв всю спесь, от своих слов отказался.
Версия о причастности КГБ к покушению на Иоанна Павла II во времена Горбачёва с превеликим рвением пытался доказать председатель КГБ Бакатин. В 1991 году, после того как в знак доброй воли он передал американцам по просьбе Горбачёва схему «прослушки» посольства США в Москве, Бакатин не без указания сверху принялся искать в архивах Лубянки компромат на возглавляемую им службу. Что характерно, никаких следов найти так и не удалось, очевидно, потому что их никогда и не было.