В момент, когда чада поклонились преподобным, Матушка отошла. В это время, на голубом солнечном небе показалась туча, подплыла к тому месту, где молились чада матушки Алипии и из нее начал падать густой крупный снег.
На следующий день утром прибыли сестры Флоровского монастыря и облачили старицу по монашескому чину. Тело старицы было теплым и мягким. Первую панихиду по ней совершил иеромонах Роман Матюшин, приехавший вместе с монахинями.
Природа была необыкновенна в этот день, будто праздничная. Земля, деревья, келия Матушки, овраг, лес все было в белом инее. Матушка лежала помолодевшая, морщин не было, лицо белое, тело мягкое и теплое. А в день похорон небо было голубым, было безветренно, тихо, присутствовал неземной покой от ощущения присутствия Царствия Божия. Отпевание было торжественно совершено духовенством Флоровского монастыря в этой святой обители при большом стечении народа. Похоронена была матушка Алипия на монашеском участке Флоровского монастыря Лесного кладбища города Киева.
С тех пор народная любовь к старице не угасает. Следуя ее благословению, идут и идут к ней люди, несут к ней свои тяготы и уходят он нее с облегчением. Слава о чудесах, которые стали совершаться на могиле блаженной, начала все более и более распространяться в народе и вскоре люди потекли к своей ходатаице нескончаемым потоком. С утра и до позднего времени у гроба старицы были люди, а по тридцатым числам каждого месяца стечение народа было столь большим, что для того, чтобы приложиться ко кресту на могилке нужно было стоять в очереди несколько часов.
По благословению митрополита Киевского Владимира (Сабодана) останки монахини Алипии (Авдеевой) были обретены рано утром 18 мая 2006 года духовенством Свято-Покровского монастыря «Голосеевская пустынь» и торжественно перенесены в обитель, возрождение которой предсказывала блаженная.
На месте ее дома, по слову старицы, построена пятикупольная часовня. Останки Матушки вначале были выставлены в большом храме в честь иконы Богоматери «Живоносный источник», а потом перенесены в усыпальницу под этим храмом и помещены в мраморный саркофаг. Традиции, которые установились на могилке Матушки на Лесном кладбище, продолжаются и в обители. По тридцатым числам, а также в день годовщины смерти Матушки 30 октября, в день ее рождения 16 марта, и обретения останков 18 мая совершаются торжества, готовится трапеза для народа, служатся многочисленные панихиды, стекаются богомольцы со всех стран СНГ, Ближнего и Дальнего Зарубежья. В день двадцатилетия со дня кончины старицы наблюдалось стечение народа более пятидесяти тысяч человек, все улицы, ведущие к монастырю, были заполнены паломниками.
Сурово завывает вьюга,
Ночная мгла пугает и страшит,
В лесу, внутри большого дуба,
Подвижница молитвочку творит.
Не слышен вой ей: то ли волчий, то ли ветра,
Не пробирает душу стужащий мороз,
Любовию Христовою согрета
И умиленьем благодатных слез.
Алипия ее монашеское имя,
Три года на молитвенном посту
За грешный люд, за грешную Россию
Прошения в дупле несла Отцу.
Крест, данный свыше, был нелегок,
Его несла она смиренною душой,
Пусть называли некоторые ее убогой,
У Бога избранницей она была благой.
Оставшись в малолетстве сиротой,
Свой крестный путь в скитаньях начала,
Псалтырь читала по родным за упокой,
Что люди подавали тем жила.
Но чаще гнали, реже подавали,
Душой на небе, юродством на земле,
Путь, устланный лишеньями, скорбями,
С молитвой и в концлагере, и в тюрьме.
Не за себя молилась за людей:
Священников, ведущих на расстрел,
За погибающих от голода детей,
За Россию, чтоб враг не одолел.