Иуда Фома вынужден был подчиниться и отправился в Индию. Они прибыли в город Андраполис (в сирийском тексте — Сандарук, название, которое связано не с названием места, а с собственным именем иранского происхождения, возможно, какого-то правителя). В городе было празднество — царь выдавал замуж свою дочь, и все. включая чужеземцев, были приглашены на пиршество. Во время пиршества выступала флейтистка, на которую Фома не смотрел. Тогда один из виночерпиев ударил его по лицу, а апостол произнес, что Бог простит слуге содеянное зло в мире, который наступит, но в этом мире рука, которой слуга ударил апостола, будет оторвана собакой. После этого Фома запел песню на еврейском языке, которую поняла только флейтистка-еврейка.
Дальше рассказывается о чуде возмездия — на ударившего апостола виночерпия нападает лев, разрывает его, а собака, схватив его руку, приносит ее в пиршественный зал. Жестокость наказания несоразмерна проступку (не преступлению), но апокрифический рассказ ставит своей целью устрашить всех, оскорбляющих христианских проповедников.
Дальнейшее повествование содержит описание разных деяний апостола, не всегда сюжетно связанных друг с другом, первое деяние — его проповедь жениху и невесте дочери Царя, которых он обращает в христианство, и девушка отказывается стать фактической женой из-за любви к Христу, традиционное для апокрифической литературы требование целомудрия. Царь пытался найти Фому, чтобы наказать его, но не нашел, а молодые обратили в свою веру и самого царя и его окружающих.
Следующее деяние (второе) связано со строительством дворца для Гундафора. Царь поручил Фоме построить дворец, дал ему золота и серебра, но Фома все это раздавал бедным, а сам ходил по селениям и проповедовал христианство. Когда царь пожелал осмотреть строительство, он увидел, что ничего не сделано, он решил казнить и Фому и купца Аббана. У царя был любимый брат, который как раз в это время умер; душу его взяли ангелы на небо и показали ему дворец, который Фома построил на небесах своими добрыми делами. Брат царя после этого ожил и попросил царя продать ему дворец на небесах. Тогда царь освободил Фому (Иуду сирийской версии) и купца, раскаялся в содеянном. Иуда Фома окрестил его и множество других людей, сказав перед этим проповедь, обращенную ко всем людям с призывом воздержаться от прелюбодеяния, любострастия и поклонения демонам. Затем он причастил их, и на этом закончилось деяние третье. В «Деяниях Фомы» достаточно быстро и легко христианами становятся цари — в отличие от долго преследовавшего Матфея царя людоедов. Индийские цари казались автору и переводчикам апокрифа менее подверженными влиянию языческих верований. Скорее всего, их представление об индийских верованиях отличались от представлений об античном язычестве, поэтому в апокрифе не разрушаются храмы и не низвергаются статуи. А принятие христианства царями подчеркивало всеобщее влияние учения Иисуса на самые разные слои населения, с одной стороны, и косвенное признание земной власти, если она не выступает против новой религии — с другой.
В одном из деяний рассказывается о победе Фомы над черным змеем (драконом в греческой версии), олицетворявшем дьявола — настойчивый мотив апокрифических деяний о неизбежности победы над злыми силами. В этом деянии интересен монолог дракона, где он перечисляет свершения дьявола, своего родича, который оказывается ответственным за все дурные поступки людей, начиная от соблазнения Евы, убийства Каином своего брата Авеля и вплоть до предательства Иудой Иисуса и Его казни. Христианская идея искупления грехов через предназначенное Богом распятие Христа здесь фактически отсутствует. Сатана выступает как могучая злая сила, почти что равная Богу. Перенос вины с человека на Сатану и его приспешников, характерная черта психологии людей Поздней античности, здесь выражена наиболее последовательно.