Бессменным шефом является генерал Муса Арафат (двоюродный брат Ясира Арафата). В отличие от руководителей других секретных служб автономии, он избегает контактов с израильтянами.
Есть документальные свидетельства причастности сотрудников к организации терактов и связях с «Бригадами мучеников аль-Акса» (ФАТХ).
4. Служба общей безопасности («Аль-Амн аль-Викаий») — самая мощная секретная служба автономии. Она была первой палестинской спецслужбой, признанной Израилем. Официально считается контрразведывательным органом, однако в действительности имеет гораздо более широкий комплекс полномочий.
Ее главные обязанности — обеспечение внутренней безопасности, контроль над оппозиционными экстремистскими группировками и политическими организациями. Помимо прочего занимается сбором разведывательной информации на территории Израиля. Многие ее сотрудники до принятия на службу являлись активистами ФАТХа и были причастны к террору.
Насчитывает свыше 5 тыс. постоянных сотрудников и тысячи агентов. Руководитель в секторе Газа — Рашид Абу-Шбак, на Западном берегу — Зияд Харб ар-Рих (ранее эти должности занимали Мохаммед Дахлан и Джибриль Раджуб).
5. Служба общей разведки («Аль-Мухабарат аль-Амма») — аналог израильской разведки «Моссад». Была создана в Тунисе генералом Амином аль-Хинди. Он же возглавляет организацию в секторе Газа.
В прошлом он был членом знаменитой террористической организации «Черный сентябрь» и причастен к убийству 11 израильских спортсменов в Мюнхене в сентябре 1972 г. После этого ушел в глубокое подполье, опасаясь возмездия израильских спецслужб. С конца 80-х — начала 90-х отвечал в структуре ООП за установление связей с ЦРУ.
Командир на Западном берегу — Тауфик Тирауи.
Обучение осуществляли сотрудники ЦРУ. Основная задача — противодействие ШАБАКу. Спецслужба проводит операции как на территории автономии, так и за ее пределами. Она обладает разветвленной агентурной сетью на базе палестинской диаспоры в странах Ближнего
Востока, а также в США, Латинской Америке и Западной Европе. Она курирует сотрудничество палестинских спецслужб с параллельными организациями за рубежом.
В составе «Мухабарат аль-Амма» насчитывается около 3 тыс. кадровых офицеров. Причастна к организации диверсий против израильских военных и сотрудников спецслужб.
6. Специальная безопасность («Аль-Амн аль-Хас») — секретная служба, несколько десятков сотрудников. Руководитель — Мухаммад Натур. Основная задача: сбор информации об оппозиционных организациях, проведение внутренних расследований.
7. Полиция («Аш-Шурта») — свыше 12 тыс. сотрудников (7,5 тыс. — в секторе Газа, 4,7 тыс. — на Западном берегу). Начальник — генерал Рази Джибали. Обучение осуществляли сотрудники полиции стран Европы (в частности, Великобритании). С осени 2005 г. обучают египетские инструкторы. Выполняет стандартную полицейскую работу: ежедневное патрулирование, задержание преступников, расследование преступлений. В последние годы работает крайне неэффективно. Сотрудники палестинской полиции неоднократно препятствовали действиям израильских военных на территории автономии.
8. Морская полиция («Аш-Шурта аль-Бахрия» — «Береговая охрана») — около тысячи сотрудников. Командир — Джумаа Рэйли. Задача: патрулирование прибрежной зоны и охрана тюрем, где содержатся «морские нарушители».
9. Женская полиция («Аш-Шурта аль-Нисаийя») — примерно 300 сотрудниц. Командир — Фатма Барнауи. Задача: регулярное патрулирование и борьба с правонарушительницами.
10. Гражданская оборона («Ад-Дифа аль-Мадани») — около 1,5 тыс. оплачиваемых сотрудников, не считая добровольцев. Руководитель — Махмуд Абу-Марзук. Задача: эвакуация населения в критических ситуациях и пожарная охрана.
11. Воздушная полиция («Аш-Шурта аль-Джавийя») — несколько десятков сотрудников. Командующий — бригадный генерал Фати Зейдан. Задача: обеспечение безопасности полетов и контроль авиаперевозок (в течение последних трех лет, после того как вертолеты Арафата были уничтожены, служба неактуальна).
12. Общая администрация служб безопасности («Ида-ра аль-Аммма аль-Амн») — численность неизвестна. Руководитель — Юсеф Насер Биштауи. Задача: координация организационных действий всех силовых ведомств (поставка амуниции, страховка сотрудников, медицинское обслуживание, подготовка и инструктаж, финансирование). Кроме того, занимается координацией действий при охране мероприятий, в которых принимают участие палестинские лидеры.