Несмотря на то, что ханства эти управлялись ханами из дома Чингизидов, права наследия не были точно определены, выбор в ханство зависел от совета вельмож, что способствовало интригам, подкупам, насилию, следовательно, давало силу вельможам и ослабляло власть хана. Притом границы между ханствами также не были точно определены, и это тоже давало повод к ссорам и междоусобицам, к войнам, во время которых многие из подданных этих четырех ханств, будучи потомками Чингисхана, отказывались повиноваться главным ханам и, сделавшись независимыми, в свою очередь ссорились и воевали между собой. Все эти события привели к ослаблению потомков Чингисхана и подготовили их падение почти одновременно во всех четырех ханствах. Китай первым свергнул иго монголов в 1367 году, изгнав в степи Монголии последнего Чингисова потомка, Тоган-Тимура. На западе, в Золотой Орде, велись те же междоусобицы, ослабившие Орду, пользуясь которыми Россия собиралась скинуть тяготившее ее иго. В Персии завоевания Хулагу раздробились на несколько независимых государств. Наследие Чагатая постигла та же участь.
В 1322 году на престол чагатайского ханства взошел Казанхан и за годы своего правления всеми своими действиями породил к себе ненависть среди вельмож и всеобщее негодование народа; многие из высокопоставленных лиц были готовы открыто выступить против хана, и после сражения в 1346 году Казанхан был убит. Спустя несколько лет после его смерти вспыхнули междоусобицы, пользуясь которыми один из потомков Чингисхана, владелец земель к северу от Сырдарьи Туклук-Тимурхан, предъявил свои права на престол предка и с сильной армией, в составе которой было много узбеков, в 1359 году перешел через реку Сырдарья и без большого труда захватил все пространство между реками Сырдарья и Амударья, став, таким образом, правителем Восточного Туркестана, Кульджинского края и Семиречья. Из страха перед его армией часть властьимущих вельмож из потомков Чингисхана укрепилась в Хорасане и Афганистане. Другая часть, считая сопротивление бесполезным, покорилась. В числе последних был и Тимур, потерявший к тому времени отца и не успевший еще приобрести влияние между своими соотечественниками. Но он не довольствовался одной лишь покорностью, а отправился в армию неприятеля с подарками, сумел спасти свои земли от грабежа и посеять вражду во владениях Туклук-Тимурхана. А благодаря своему внешнему смирению Тимур получил от Туклук-Тимурхана утверждение в своем владении (стал наместником кашкадарьинского вилайета), командование над десятитысячным корпусом и должность советника при дворе его сына Ильяса-ходжи, правителя Мавераннехра. К тому времени у сына бека из племени барласов уже был собственный отряд преданных воинов.
Но союз Тимура с правительством Ильяса-ходжи из-за раздоров между кочевниками (язычниками) и оседлыми (мусульманами) длился недолго. Судя по источникам того времени, происходили столкновения между Тимуром и узбекскими племенами, что и вызвало гнев Туклук-Тимурхана, и по его приказанию Тимур должен был умереть. Но приказ какими-то путями попал в руки самого Тимура. Под угрозой нависшей над ним опасности и видя возможность пленения собственными соотечественниками, он решает собрать смелых и решительно настроенных воинов, чтобы выступить против узбеков. Но когда его намерения раскрывают, он вынужден бежать за реку Амударью в сопровождении своего воинского отряда в 60 человек, чтобы укрыться в Бадахшанских горах. Находясь в таком плачевном положении, Тимур начинает скитаться по туркестанским степям, возя с собой свою первую жену, сестру эмира Хусейна, в ожидании счастливого поворота судьбы.
Во время этих странствий он попадает на земли, владелец которых, Али-бек, желая угодить Ильясу-ходже, берет Тимура в плен. Будущий великий эмир оказывается заточенным в подземелье, а точнее в колодце, кишащем насекомыми, в котором вместе со своей женой он проводит, по разным сведениям, от 50 до 62 дней. После чего один из преданных ему людей освобождает его из заточения. Тимур (не будем пока вспоминать о движущих им корыстных мотивах), умеет помнить добро и быть благодарным за верность: позднее этот человек станет министром при его дворе. Во время заточения Тамербек дает себе слово никогда и никого не брать под арест, прежде чем лично не разберется в его деле и не убедится в необходимости и заслуженности подобной меры наказания.
В итоге всех этих перипетий Тимур, сопровождаемый двенадцатью оставшимися воинами, отправляется бродить по степям. Со временем его отряд начинает пополняться, и, укрепив свои силы, Тимур заключает военный союз с правителем Балха и Самарканда эмиром Хусейном. Через несколько месяцев их совместный отряд оказывается в Сеистане. Именно там Тимур получает ранение стрелой в руку, отчего у него на правой руке кости неправильно срастаются, и в правую ногу, которая становится короче левой из-за того, что кость бедра срослась с коленной чашечкой. С тех пор его стали называть – Тимур-Ленгом, или Хромым Тимуром. Интересен факт, что в память Тимура навсегда впечатался образ ранившего его человека и много лет спустя, в 1383 году, в Сеистане, вновь повстречавшись с ним, Тамерлан приказал расстрелять виновника своего увечья из луков.