Находясь в постоянном контакте с папским престолом, Герман фон Зальца сыграл существенную роль во всегда сложных отношениях между папством и империей. Он, кто должен был в силу возложенных на него обязанностей стать духовным и военным руководителей, в то же самое время превратился в дипломата, постоянно разъезжающего между Палестиной, Сицилией, Римом и империей. Он использовал свой талант дипломата, дабы добиться прекращения извечного конфликта между императора и понтифика, длившегося со времен Барбароссы, усугубившегося при Фридрихе II, и найти вместе с Фридрихом II дипломатическое решение, выгодное для всех христиан в вопросе владения Иерусалимом.
Политическая и дипломатическая деятельность Германа фон Зальца неразрывно связана с царствованием Фридриха II Гогенштауфена. После смуты, последовавшей за смертью Генриха VI в 1197 г., папство вначале поддержало Вельфа Отгона IV против другого кандидата на наследство, Филиппа Швабского, брата умершего императора. Убийство Филиппа в 1208 г. серьезно усилило позиции Отгона IV, который был коронован и миропомазан 4 октября 1209 г. папой Иннокентием III. Но сын Генриха VI — молодой Фридрих II, король Сицилии с 1198 г., потребовал для себя императорскую корону поскольку при жизни отец назначил его королем римлян (т. е. виртуальным наследником императорской короны). Чрезмерные амбиции Оттона IV в отношении Сицилии привели к тому, что папа перестал его поддерживать и повернулся к Фридриху II. В Германии Фридрих II пользовался поддержкой некоторых князей. Король Франции Филипп Август, обеспокоенный сближением Оттона IV и Англии, тоже оказал помощь молодому королю Сицилии. Сейм в Нюрнберге, созванный по просьбе Иннокентия III, провозгласил Фридриха императором, а в январе 1212 г. посольство сейма отправилось в Палермо, чтобы сообщить новость королю Сицилии. Избранный, но еще не коронованный император поехал в Германию, чтобы пройти церемонию миропомазанию. По дороге он встретил в Мессине папу, который потребовал настоящего акта повиновения, после чего в пасхальное воскресение 1212 г. он был, согласно традиции, «единодушно провозглашен римским народом». Папа затребовал дорогую плату за свою поддержку; он потребовал от Фридриха II отказаться от короны Сицилии в пользу своего сына, в случае если будет коронован императором. Летом 1212 г. молодой государь наконец вступил на германскую землю: проехав через Констанц и Карлсруэ, он прибыл во Франкфурт, где сейм, собравшийся 5 декабря, низложил Оттона IV и объявил Фридриха законным императором. 9 декабря состоялась символическая коронация, правда не имевшая юридического обоснования, так как Ахен все еще оставался под властью Оттона IV, а именно там и должна была проходить церемония.
Герман фон Зальца был осведомлен о событиях в Германии через своих представителей при дворе папы и братьев германских домах своего ордена. Положение оставалось неопределенным еще в течение восемнадцати месяцев. Победа при Бувине, одержанная 27 июля 1214 г. Филиппом Августом и его союзниками, решила судьбу Оттона IV. Оставшись без поддержки, Отгон отступил на свои земли. Фридрих II, к которому присоединилась большая часть тех, кто до сих пор поддерживал его соперника, получил наконец 25 июля 1215 г. императорские инсигнии из рук архиепископа Майнца Зигфрида в соборе Ахена. На следующий день перед епископами и придворными сановниками он торжественно поклялся стать крестоносцем и отправиться в Святую землю, как только в Германии воцарится мир.
К этому времени Фридрих II подтвердил свое полное доверие Тевтонскому ордену, как это делали до него его предшественники. В императорском дипломе от 23 января 1214 г. Фридрих II объявил великого магистра ордена и всех его преемников полноправными членами императорского двора и даровал право жить при дворе всем магистрам и их свите каждый раз, как они туда прибудут. Кроме того, такая же привилегия была пожалована посланникам великого магистра к императору и двум постоянным представителям ордена при дворе.
Во время церемонии коронации Герман фон Зальца впервые встретился с тем, чьим верным советником он будет на протяжении более чем двадцати лет. Великий магистр Тевтонского ордена и Фридрих II поправились друг другу при первой же встрече. Она положила начало тесному сотрудничеству между столь разными по темпераменту личностями, сотрудничеству длительному, превратившемуся в нерушимую дружбу. Импульсивному и вспыльчивому характеру императора противостояли спокойствие, равновесие и сдержанность Германа фон Зальца. Это взаимное дополнение и тому и другому принесло несомненную выгоду. Герман фон Зальца был допущен в совет ив 1216 г. участвовал в заседания Нюрнбергского сейма, где проявил себя одним из самых верных защитников императорской политики. Отныне орден тевтонских рыцарей оказался непосредственно связан со всеми политическими предприятиями Фридриха II.