15 мая 1935 года на основании приказа командующего ТОФ № -0173 5 дивизион 1-й БПЛ передали в 3-й БПЛ.
В октябре 1935 года штормом на камни была выброшена подводная лодка Щ-103 (исключена из состава флота 15 июня 1939 года).
30 декабря 1935 года на общефлотском слете стахановцев и отличников от 2-й бригады ил участвовало 50 человек. Орденом Ленина награждены командир бригады подводных лодок А.И.Зельтинг и командиры подводных лодок: М-1 – Н.И.Виноградов, М-12 – Ф.Ф.Павлов, М-9 – М.И.Гаджиев, М-6 – В.А.Мазин, М-23 – И.Н.Тузов, М-25 – А.Л.Поскотников, М-26 – В.В.Гречко, М-16 – И.И.Байков, флагманский минер бригады Н.И.Шибаев. За успехи в боевой подготовке орденом Ленина награждены: старшина группы трюмных А.Г.Бердников, торпедист П.В.Мисилин, старшина группы мотористов А.Е.Ерофеев, командир отделения трюмных Э.А.Салло, командир отделения рулевых Н.Ф.Конанчев, старшина группы мотористов А.И.Балакин, старшина группы электриков А.А.Попов, старшина группы Н.А.Петров, моторист подводной лодки М-11 Ф.М.Иванов, командир отделения А.С.Ципеляев, старший радист В.Т.Мокроусов, старшина команды торпедистов И.А.Сацков, старшина группы рулевых Л.А.Хлевтюк, штурманский электрик А.А.Уханов, рулевой Н.Т.Баранов, старшина группы электриков П.А.Михайличенко, старший радист подводной лодки М-16 М.А.Старцев.
Экипажи подводных лодок М-2 и М-5 за успехи в Боевой и политической подготовке были передовиками стахановского движения на флоте и стали полностью орденоносными экипажами.
1936 год
На 1 января 1936 года в составе 3-й БПЛ состояло восемь подводных лодок (с Щ-117 по Щ-124), в это же, время началось формирование береговой базы бригады в бухте Находка. 1 апреля 1936 года приказом по ТОФ № – 0131 VI дивизион ПЛ назначили учебным дивизионом с оставлением в составе бригады. С мая и до конца 1936 года вступили в строй подводные лодки Щ-125, Щ-126, Щ-127, Щ-128 (зачисленные в 33 дивизион) и подводные лодки Щ-129, Щ-130, Щ-131, Щ-132 (зачисленные в 34 дивизион). 28 января бригада пополнилась 202 подводниками, прибывшими с Черноморского флота.
8 февраля 1936 года приказом командующего ТОФ №-08 началось формирование дивизиона подводных лодок тип «Л», которому присвоили наименование 9 дивизиона 4-й Бригады подводных лодок (6 морская бригада). Для размещения личного состава дивизиону выделили гидрографическое судно «Приморье», переданное из гидрографического отдела ТОФ.
10 апреля 1936 года приказом командующего ТОФ № – 0022 была установлена новая нумерация дивизионов существующих Бригад подводных лодок.
19 августа 1936 года по приказу командующего ТОФ №-0053 началось формирование штаба 4-й БПЛ с дислокацией во Владивостоке (бухта Золотой Рог). В ноябре-декабре 1936 года в состав 4-й БПЛ вошли подводные лодки Л-7, Л-8, Л-9, зачисленные в 41 дивизион подводных лодок, а в ноябре 1937 года – Л-10. В октябре-декабре 1938 года в строй вошли подводные лодки Л-11, Л-12, Л-13, Л-14, Л-15, Л-16.
В августе – сентябре совместное учебное плавание совершили пять подводных лодок и плавбаза «Саратов». Более тысячи миль прошли корабли в Японском и Охотском морях, отрабатывая торпедные атаки, артиллерийские стрельбы, общекорабельное и частные боевые задачи. Впервые в истории подводные лодки посетили порты Охотск, Магадан, Оху, залив Байкал. На острове Удд в Сахалинском заливе, где закончил свой знаменитый беспосадочный перелет Москва – Камчатка выдающийся советский летчик В.П.Чкалов, подводники установили памятный знак.
1937 год
В феврале подводная лодка М-18 совершила кратковременное плавание в сложных ледовых условиях. 8 ноября 1937 года в состав 42 дивизиона 4-й БПЛ ТОФ вошла подводная лодка Л-10.
По итогам боевой и политической подготовки 1937 года подводная лодка М-21 награждена призом «Знак КИМ», а в 1938 году подводные лодки М-8, М-12 награждены часами «Грот».
1938 год
9 июля 1938 года приказом по ТОФ №-0310 31 ДПЛ и плавбаза «Саратов» 3-й БПЛ передислоцировались из бухты Находка в Совгавань, а 14 августа передали «Саратов» – в 4-ю БПЛ, 31 ДПЛ – в 5-ю БПЛ.
1939 год
15 мая 1939 года в 4-ю БПЛ из 1 морской бригады передали надводный минный заградитель «Теодор Нетте» для использования под плавбазу.
17 мая 1939 года на основании приказа командующего ТОФ №-0087 25 ДПЛ 2-ю БПЛ в полном составе передислоцировали в Совгавань с подчинением командиру Отдельного морского отряда СГУР и исключен из состава 2-й БПЛ.
4 октября 1939 года в соответствии с постановлением СНК СССР и приказом наркома ВМФ командующий ТОФ издал приказ о формировании в составе ВМФ Северной Тихоокеанской военной флотилии. В состав СТОВФ кроме надводных кораблей вошли 31 ДПЛ (ПЛ тип «Щ») и 25 ДПЛ (ПЛ тип «М») и их береговые подразделения.