Подводные лодки С-51, С-53, С-54, С-55 и С-56 второй группой перешли на Северный флот и приняли активное участие в Боевых действиях. Две подводные лодки С-54 (командир капитан 2 ранга Д.К.Братишко) и С-55 (командир капитан 3 ранга Л.М.Сушкин) не вернулись из Боевых походов. С-55 совершила три Боевых похода, во время которых выполнила несколько торпедных атак, потопила два вражеских транспорта, высаживала разведгруппы на побережье, занятое противником. В последний Боевой поход лодка вышла 4 декабря 1943 года, в базу не вернулась.
Подводная лодка могла погибнуть на минных заграждениях при их форсировании или была атакована противолодочными силами противника в районе Гамвика. Об успешных действиях С-55 в этом Боевом походе косвенно говорят сведения об атаке 8 декабря немецкого прибрежного конвоя в устье Тана-фьерда (в пределах позиции подводной лодки). Немцами было зафиксировано нападение на конвой подводной лодки, в ходе которого одна из торпед попала в корму норвежского транспорта «Wadler» (водоизмещение 1016 тонн), торпеда не взорвалась. В ходе атаки подводная лодка пострадать не могла, немцами подводная лодка обнаружена не была, а торпеды атакованным судном были обнаружены на расстоянии 70 – 100 метров от борта. Охранявшие конвой немецкие охотники контратаку подводной лодки не производили, оставались на своих местах в ордере. На борту подводной лодки погибло 52 подводника.
С-54 после перехода на Северный флот совершила 4 Боевых похода в ходе которых выполнила несколько торпедных атак. Успеха в Боевых походах экипаж не добился, командиру не хватило мастерства и удачи. В свой последний – пятый – поход подводная лодка вышла 5 марта 1944 года. После этого С-54 на связь не выходила и в базу не вернулась. Поскольку боевая деятельность подводной лодки не была зафиксирована противником, вероятной причиной гибели считается подрыв лодки на минном заграждении NW-31, выставленном минным заградителем «Ostmark» в районе Конгс-фьерда в июле 1943 года на удалении до 7.5 миль от берега. Скорее всего, подрыв на мине произошел в первые дни похода, когда подводная лодка подходила к берегу на перископной глубине. На подводной лодке погибли 50 подводников.
Долгие годы на Тихоокеанском флоте ни на одном мемориале не были увековечены имена тихоокеанских подводников, воевавших и погибших во время Боевых действий в составе Северного флота. Только после 2005 года подводники двух северных «эсок» вновь были признаны тихоокеанскими – сначала в Книге Памяти подводников-тихоокеанцев, впоследствии и на мемориале «Боевая слава ТОФ» появились списки с фамилиями экипажей подводных лодок С-54 и С-55.
Накануне 65-летия Победы советского народа в Великой Отечественной войне во Владивостоке подводниками восстановлена историческая справедливость – на мемориале «Боевая слава ТОФ» установлены памятные плиты с фамилиями экипажей подводных лодок Тихоокеанского флота, погибших в 1941 – 1945 годах. Долгие годы, с далекого 1982 года, когда был открыт мемориал «Боевая слава ТОФ», на стене памяти среди нескольких тысяч приморцев, погибших в Великой Отечественной войне, не было фамилий моряков – подводников, не вернувшихся из Боевых походов. По инициативе подводников при активном участии и поддержке командующего ТОФ вице-адмирала К.С.Сиденко, контр-адмиралов А.Н.Войтовича, С.Н.Беленова, капитанов 1 ранга М.И.Сажаева, Д.А.Струкова, капитана 2 ранга Д.В.Кисилева была организована работа на мемориале. Начальником музея Тихоокеанского флота капитаном 3 ранга Е.В.Журавлёвым в кратчайший срок было организовано изготовление памятных плит и их установка на мемориале. Свой вклад в сохранение памяти о моряках, не вернувшихся из боевых походов, сумели внести многие сегодняшние подводники – шесть плит были изготовлены на средства, собранные на шести тихоокеанских соединениях подводных лодок.
Торжественное открытие памятных плит состоялось 7 мая 2010 года с участием Губернатора Приморского края С.М.Дарькина, Командующего Тихоокеанским флотом вице-адмирала К.С.Сиденко, мэра города Владивостока И.В.Пушкарёва, ветеранов Великой отечественной войны и флота, общественности. По правому борту подводной лодки – мемориала С-56 в одном парадном строю встали экипажи навечно ушедших в глубины подводников тихоокеанских подводных лодок М-49, М-63, Л-16, Л-19 и воевавших на Северном флоте С-54, С-55.