Самовольные действия украинского гетмана в этих условиях ставили русское правительство в очень сложное положение. Формально оно отвечало за поступки украинского казачества, но на самом деле оно не подчинялось Москве. Хмельницкий стремился проводить собственную политику, не согласуя ее с политикой государства, составной частью которого являлись и украинские земли.
Определение дня смерти Хмельницкого долго вызывало разногласие. Теперь установлено, что он умер 27 июля (6 августа) 1657 года от кровоизлияния в головной мозг (инсульта) в Чигирине и был похоронен рядом с телом его сына Тимофея в селе Суботове, в построенной им самим каменной Ильинской церкви. В 1664 году польский воевода Стефан Чарнецкий сжёг Суботов и повелел выкопать прах Б. Хмельницкого и его сына Тимофея и выбросить их тела на «поругание» из могилы.
Гетманщина
После смерти Б. Хмельницкого гетманом Украины стал его младший сын Юрий, но правил недолго, потому что был слишком молод (16 лет) и не имел необходимого опыта. Отрекшись от власти, он ушел в монастырь.
Гетманом в 1657 году на совете в Чигирине был избран Иван Выговский.
«Он был шляхтичем и раньше работал в польском правительстве. В сражении под Желтыми Водами он попал в плен к татарам, но Б. Хмельницкий выкупил его и доверил ему чин генерального писаря. Гетман во всех делах советовался с Выговским, и писарь был ему самым верным товарищем…
Выговский, как и Хмельницкий, видел, что Москва намерена поработить Украину для того, чтобы господствовать там. Чтобы спасти Украину он заключил союз со Швецией и с Крымом. Тогда московские бояре начали кампанию против Выговского, распуская слухи, что он не украинец, а поляк… Они обещали большие деньги и чины всем, кто выступит против гетмана и поможет Москве овладеть Украиной. Умные люди видели эту московскую хитрость и злобу и не слушали московских агитаторов. Но среди темного народа нашлось много таких, которые поддались на московские обещания и начали бунтовать против гетмана. Бунт возглавили полтавский полковник Мартин Пушкар и запорожский кошевой атаман Барабаш. Но Иван Выговский со своими верными полками победил этих своевольных казаков. После этого он задумал объявить войну Московщине и вернуть самостоятельность Украине. Для этого в Гадяче он подписал соглашение с поляками…
Выговский пошел походом на московских воевод. Под Конотопом в 1659 году произошло сражение. Украинские войска разгромили врага. Московские воеводы с целым войском попали в плен, большой лагерь и пушки стали добычей украинцев. На Москву напал такой страх, что царь готовился бежать за Волгу. Но эта большая победа не принесла пользы Украине…» (История Украины. Львов, 1991. С. 91–93).
«Чтобы ослабить влияние Москвы на Украине Выговский заключил союзный договор со Швецией, а затем начал переговоры и с Речью Посполитой. Это вызвало недовольство части казацкой старшины. Вооруженное восстание против гетмана подняли войсковой кошевой Я. Барабаш и полтавский полковник М. Пушкар. Воспользовавшись этим, московской царь в феврале 1658 года послал на Украину окольничего Б. Хитрова для образования там антигетманской коалиции. Тогда И. Выговский собрал верные ему полки и, позвав на помощь крымских татар, подавил промосковское восстание. В этой братоубийственной войне погибло 50 тыс. украинцев, в том числе М. Пушкар и Я. Барабаш.
Стремясь освободить Украину из-под московской опеки, гетман И. Выговский 16 сентября 1658 года в Гадяче подписал договор с польским правительством, в соответствии с которым Украина в составе трех воеводств — Брацлавского, Киевского и Черниговского под названием Великого княжества Русского — входила в состав Речи Посполитой наравне с Польшей и Литвой, сохраняя свои суд, финансы, денежную систему и армию. Уничтожалась уния. Православная церковь во главе с украинским митрополитом, духовенство и верующие уравнивались в правах с католиками. Однако Украина лишалась права внешнеполитических отношений. Предложенный казачий реестр (армия) численностью в 60 тыс. человек сокращался наполовину.
Хотя польский сейм и ратифицировал Гадячский договор, но ему не было суждено претвориться в жизнь. Польские войска, которые по договору должны были прийти на помощь казакам для борьбы с московским царем, начали самовольничать на Украине, а шляхта стремилась снова поработить ее.