Резкое снижение уровня производства в промышленности больно ударило и по её военному сектору. Несмотря на то, что именно в нём концентрировалась большая часть квалифицированной рабочей силы, финансовых средств и материалов, выпуск военной продукции быстро сокращался.
В первой половине сорок пятого года намечалось выпустить 20 тыс. самолётов, но фактически в январе — августе было произведено чуть больше 11 тысяч. Половину из них (5474 шт.) составили истребители и четверть (2523 шт.) — учебные самолёты, пригодные к переоборудованию для «камикадзе» (самолёты-торпеды под управлением лётчиков-самоубийц).
Из-за острого дефицита стали, японскому судостроению пришлось отказаться от строительства крупных боевых кораблей (класса выше эсминца). Главное внимание сконцентрировалось на выпуске специальных средств, предназначенных для «смертников»: малотоннажных катеров («сине»), микролодок («корю» и «кайрю»), человеко-мин («фукурю») и человеко-торпед («кайтэн»). Только во втором квартале сорок пятого их производство составило 1733 единицы.
Войну до «победного конца» предполагалось вести сухопутными войсками, что и предопределило их стремительный количественный рост. В результате тотальной мобилизации, проводившейся с начала сорок четвёртого по август сорок пятого года, вооружённые силы Японии увеличились до 7,2 миллиона человек против 3,8 миллиона в начале сорок четвёртого. Их основу составляли сухопутные войска, которые, вместе с включёнными в их состав авиационными соединениями, достигли 5,5 миллиона человек.
Некогда мощный японский флот к середине сорок пятого уже не представлял былой силы. Он имел 109 боевых кораблей, в том числе 3 авианосца, 1 линкор, 3 крейсера, 44 эсминца, 58 подводных лодок, а также 3 тыс. подводных лодок «кайрю», «корю» и управляемых человеко-торпед «кайтэн». Общая численность личного состава флота достигла 1,7 миллиона человек. Значительную часть его планировалось использовать в операциях на суше, особенно при обороне метрополии.
Громоздкой и неэффективной оставалась система японского военно-политического руководства. Она не позволяла чётко координировать работу государственных органов, в частности кабинета министров и императорской Ставки.
Учреждение Высшего совета по руководству войной в августе сорок четвёртого не решило проблемы по существу, так как входившие в него представители императорской Ставки и правительства не составляли единого целого, а только согласовывали военно-политические вопросы. Как и раньше, премьер-министр не мог принимать участия в совещаниях Ставки. Только с марта сорок пятого года, по указанию императора Хирохито, являющегося по японской конституции Верховным Главнокомандующим, ему было разрешено присутствовать на этих совещаниях.
Императорская Ставка, хотя и объединяла военный и военно-морской отделы, замыкавшиеся, соответственно, на начальника Генштаба сухопутных войск и начальника морского Генштаба, не являлась высшим органом согласованного военного руководства, так как оба начальника Генштабов подчинялись непосредственно императору.
Робкую настойчивость в созданий единого командования проявляло руководство армии, исходившее из предпосылки, что именно сухопутным войскам придётся вести решающую битву. Но усилия военного министра Анами в апреле сорок пятого года создать единое военное командование не увенчались успехом — возражало военно-морское командование.
Расчёты Японского правительства на всемерное затягивание войны не являлись секретом для руководителей Америки и Великобритании. В середине июня сорок пятого американский комитет начальников штабов пришёл к выводу: «В целом Япония использует все политические средства, чтобы избежать полного разгрома или безоговорочной капитуляции.
Её усилия впредь будут сводиться к следующему:
а) Продолжать и даже усиливать попытки добиться полного политического единства империи.
б) Поддерживать среди врагов Японии мысль, что если Объединённые Нации будут настаивать на полном завоевании империи, то война будет длительной и дорогостоящей.
в) В случае необходимости предложить Советскому Союзу существенные территориальные и иные уступки, попытаться убедить его сохранять нейтралитет, и в то же время прилагать все усилия, чтобы посеять разногласия между американцами и англичанами, с одной стороны; и русскими — с другой».
Американское военное командование понимало, что боевые операции на территории Японии будут сопряжены с большими трудностями. В отличие от боёв сил флота и морской пехоты за отдельные острова, в метрополии главная роль будет принадлежать сухопутным войскам. При этом должно неизмеримо возрасти сопротивление противника. Силы вторжения понесут большие потери. Поэтому, после овладения островами Иводзима и Окинава, действия союзников на Тихоокеанском театре военных действий свелись к авиационным бомбардировкам и обстрелам дальнобойной корабельной артиллерией промышленных центров страны на восточном побережье. В достижении окончательной победы над Японией союзники, особенно американцы, возлагали большие надежды на участие в войне Советского Союза.