К вопросу об общем подходе дореволюционной историографии к правлению Ивана Грозного // Историография истории СССР: проблемы преподавания и изучения / Отв. ред. М. В. Нечкина. Калинин: Калининский государственный университет, 1985.
Психология русской истории // Страна и мир. Мюнхен, 1990. Май–июнь (№ 3 (57)).
Опричнина Ивана Грозного: что это такое? // Родина. 1991 № 1; Археографический ежегодник. 2003 год / Отв. ред. С. О. Шмидт. Москва: Наука, 2004.
След в след: Хроника одного рода в мыслях, комментариях и основных датах // Урал. 1991. № 6–8.
Репетиции // Нева. 1992. № 1–2.
До и во время // Новый мир. 1993. № 3–4.
«Мне ли не пожалеть…» // Знамя. 1995. № 12.
Старая девочка // Знамя. 1998. № 8–9.
Воскрешение Лазаря // Знамя. 2002. № 8–9.
Будьте как дети // Знамя. 2008. № 1–2.
Возвращение в Египет // Знамя. 2013. № 7–8.
Царство Агамемнона (фрагмент) // Знамя. 2018. № 4.
Апрель // Сноб. 2013–2014. Декабрь–январь (№ 12–01 (65–66)).
Истории со Щеном // Сказки без подсказки. Москва: Детская литература, 1981.
Десять историй о Щене // Первое сентября. 1995. Сентябрь–октябрь.
Стихи // Новый мир. 1980. № 8.
«С реки уходит накипь снега…» // Сельская молодежь. 1981. № 7.
Опричнина // Родина. 1991. № 1.
Столица и провинция: два пути понимания жизни // Москва. Территория 2000. М.: GIF, 1999.
«Реалистические» соображения // Знамя. 2000. № 4.
«Это я: я прожил жизнь» // Дружба народов. 2000. № 12.
Несколько мыслей в защиту либерализма // Дружба народов. 2001. № 10.
Конфликт цивилизаций: подводная часть // Знамя. 2003. № 4.
Икона святого Георгия Победоносца с клеймами // WAM. 2003. № 4.
Меж двух революций // Знамя. 2005. № 9.
Памяти Пролетарской Силы // Знамя. 2009. № 8.
Когда Шера в форме. Истории моего отца // Знамя. 2009. № 10.
Очерк христианской благотворительности // Жить со смыслом. Как обретать помогая и получать отдавая. М.: Эксмо, 2010.
Якобсон и вторая школа // Памяти Анатолия Якобсона. Сборник воспоминаний к 75-летию со дня рождения / Сост. А. Зарецкий, Ю. Китаевич. Бостон: M-Graphics Publishing, 2010.
Народ Андрея Платонова // Литературная матрица. СПб.: Лимбус Пресс, 2010. Т. 2.; 2‐е изд. СПб.: Лимбус Пресс, 2011.
Настоящий Гончаров // Знамя. 2012. № 12.
На чем стоим // Неприкосновенный запас. 2013. № 2.
Бал у сатаны (его эстетика и этика) // The Prime Russian Magazine. 2014. Март–апрель (№ 2 (23)).
Переписка Грозного с Курбским // Литературная матрица. Внеклассное чтение. СПб.: Лимбус Пресс, 2014.
О Геке Комарове // Танцы за плугом. СПб.: Пушкинский фонд, 2014.
«Я прожил жизнь…» // Большая книга победителей. М.: АСТ: Редакция Елены Шубиной, 2015.
Моя компания // Знамя. 2015. № 4.
Репетиции // Текст и традиция / Ред.-сост. Е. Г. Водолазкин. 2015. № 3.
Ходынка // Москва: место встречи. М.: АСТ: Редакция Елены Шубиной, 2016.
Мелкий грех // Знамя. 2016. № 11.
Снова, снова и снова можно было читать, почти как в первый раз… // Дружба народов. 2016. № 11.
Воронеж – блажь, Воронеж – ворон, нож // Знамя. 2018. № 3; Подъем. 2018. № 11.
Октябрь семнадцатого и конец истории // Знамя. 2018. № 6.
След в след: Хроника одного рода в мыслях, комментариях и основных датах. М.: Наш дом – L’ Âge d’Homme, 1996. 252 с.
След в след: Хроника одного рода в мыслях, комментариях и основных датах. М.: ОЛМА-Пресс, 2001. 285 с.
След в след: Хроника одного рода в мыслях, комментариях и основных датах. М.: ArsisBooks, 2016. 243 с.
Репетиции. «Мне ли не пожалеть…». М.: Наш дом – L’ Âge d’Homme, 1997. 344 c.
Репетиции. СПб.: Лимбус Пресс, 2003. 270 с.
Репетиции. М.: ArsisBooks, 2009. 335 с.
Репетиции. М.: АСТ: Редакция Елены Шубиной, 2019. 352 с.
До и во время. М.: Наш дом – L’ Âge d’Homme, 1995. 320 с.
До и во время. М.; СПб.: АСТ, Астрель-СПб., 2005. 395 с.
До и во время. М.: ArsisBooks, 2009. 354 с.
«Мне ли не пожалеть…» СПб.: Лимбус Пресс. Издательство К. Тублина, 2014. 282 с.
Старая девочка. М.: Наш дом – L’ Âge d’Homme, 1999. 346 с.
Старая девочка. М: Астрель, 2012. 478 с.
Воскрешение Лазаря. М.: Вагриус, 2003. 365 с.
Воскрешение Лазаря. М.: ArsisBooks, 2019. 368 с.
Будьте как дети. М.: Вагриус, 2008. 398 с.
Будьте как дети. М.: АСТ: Редакция Елены Шубиной, 2016. 446 с.
Возвращение в Египет. М.: АСТ, 2013. 759 с.
Возвращение в Египет. М.: АСТ: Редакция Елены Шубиной, 2015. 759 с.
Царство Агамемнона. М.: АСТ: Редакция Елены Шубиной, 2018. 669 с.
Стихи. М.: Наш дом – L’ Âge d’Homme, 1996. 47 с.