В апреле 1958 года был введен в эксплуатацию построенный по заказу ИПГ первый жилой дом (32 квартиры). В г. Обнинск начали переезжать на постоянное место жительства научные сотрудники и специалисты ИПГ и Высокогорной геофизической экспедиции на Эльбрусе. Для Евгения Константиновича была зарезервирована 3-х комнатная квартира, в которой он жил в конце 1950-х начале 1960-х годов во время своих многократных приездов в г. Обнинск.
Приказом по ИПГ с 1 июля 1958 года в Обнинске было организовано шесть групп научных отделов ИПГ по направлениям, которые Е.К. Фёдоров планировал развивать в будущем Филиале. Свыше пятидесяти сотрудников ИПГ, в том числе семь кандидатов наук, получивших жилье, были переведены на постоянную работу в составе этих групп. Рабочие места сотрудников были организованы в тесных каморках в одной половине барака. Здесь же в 1958–1960 годах был рабочий «кабинет» Евгения Константиновича (примерно 10 кв. м).
На данном этапе становления образованное подразделение получило наименование «Обнинский полигон ИПГ». Так Е.К. Фёдоров зародил новый научный коллектив.
Интенсивными темпами велся монтаж ВММ-310 в теплое время 1958 года. Четкая организация работ, идеальная технологическая дисциплина монтажников-высотников, подкреплявшаяся очень высокой оплатой их труда, постоянное внимание, всесторонняя помощь Евгения Константиновича, его контроль за графиком выполнения запланированных работ – все это позволило выполнить монтажные работы в кратчайшие сроки, в течение одного сезона. Немаловажным фактором было и то, что в каждый приезд в г. Обнинск Е.К. Фёдоров встречался с монтажниками-высотниками, подробно интересовался ходом работ, возникающими трудностями и неурядицами как производственными, так и бытовыми. Монтажники-высотники очень уважали Евгения Константиновича.
Обнинская высотная метеорологическая мачта (Федоровская вышка) Начало 1960-х г.
В итоге 8 октября 1958 года высотная метеорологическая мачта была введена в эксплуатацию. Горожане прозвали её «фёдоровской вышкой».
Для оперативного решения вопросов организации и проведения комплексных научных работ на полигоне в апреле 1959 года Е.К. Фёдоров своим приказом создал научно-технический совет.
Е.К. Федоров на верхней площадке ВММ-103. Начало 1960-х гг.
В середине 1959 года Е.К. Фёдоров для работы на полигоне пригласил из Челябинска-40 опытного радиохимика, д-ра хим. наук Глеба Аркадьевича Середу.
Во исполнение Постановления Бюро Президиума АН СССР от 27 мая 1960 года Е.К. Фёдоров своим приказом предписал создать в институте радиохимическую лабораторию. Такая возможность появилась в Обнинске после ввода в эксплуатацию первой очереди главного лабораторного корпуса. Уже в июле лаборатория была организована, и распоряжением Президиума АН СССР от 1 августа 1960 года её создание было узаконено.
В середине 1958 года Е.К. Фёдоров дал указание создать на полигоне научно-техническую библиотеку. В середине 1960 года НТБ была создана, она занимала в главном лабораторном корпусе три помещения, общей площадью 117 кв.м.
Большое внимание Е.К. Фёдоров уделял созданию на полигоне механических мастерских. В 1958 году первые станки, оборудование и верстаки были установлены в помещении склада, и началось выполнение заказов. После ввода в эксплуатацию в 1961 году второй очереди главного лабораторного корпуса были выделены для мастерской существенные рабочие площади (около 400 кв.м.).
Были приняты меры по созданию служб полигона, обеспечивающих ввод в эксплуатацию и поддержание в надлежащем состоянии зданий, рабочих помещений, территории полигона, жилых домов.
Учитывая большой объем в ИПГ экспедиционных работ, постоянно уделялось внимание работе автомобильного транспорта.
В 1959 и 1960-х годах для сотрудников полигона были построены два жилых дома (80 квартир).
Президиум Академии наук СССР своим Постановлением от 23 декабря 1960 года признал необходимым организовать отделение ИПГ АН СССР в г. Обнинске. Для руководства Обнинским отделением предусматривалась в штатном расписании ИПГ дополнительная должность заместителя директора Института. В начале февраля 1962 года на эту должность Е.К. Фёдоров назначил Г.А. Середу.
Е.К. Фёдоров начал формировать самостоятельные научные подразделения Отделения. Первым из них стала в середине 1961 года Лаборатория нижнего слоя атмосферы, вторым (в начале 1962 года) – отдел ядерной метеорологии.