Вопрос об эвакуации беженцев впервые был поставлен 22 января 1945 г. на совещании у фюрера. Для эвакуации можно было использовать всего лишь 18 пароходов, которые были обеспечены углем на три недели. В связи с этим Гитлер отказался от использования судов для эвакуации беженцев и приказал их транспортировку производить попутно, когда суда возвращаются из районов, подлежащих эвакуации; предполагалось использовать в этих целях таким же порядком военные корабли. До 28 января морским путем было эвакуировано 62 000 человек.
Позднее перевозки морем нарастали, и в апреле оказалось возможным эвакуировать с полуострова Хель 387 000 человек, при этом только 21 апреля было эвакуировано 28 000. 6 мая число эвакуированных за один день достигло наибольшей цифры — 43 000 человек.
Отдельные суда принимали эвакуированных с большой перегрузкой: так, лайнер «Дойчланд» 20 февраля принял 12 000 и 1 апреля — 10 000 человек! Военные корабли также производили перевозки войск и беженцев в большом объеме. Эсминец «Z 34» 16 марта при эвакуации Кольберга принял на борт 250 тяжелораненых и 1200 беженцев, что в значительной мере снизило его боеспособность. После гибели «Штойбена» ставился вопрос об отказе от использования для эвакуации больших пассажирских судов. Но это могло привести к снижению эвакуации раненых с 57 000 до 17 000 в месяц, в связи с чем это предложение отклонили. До 11 февраля санитарные суда эвакуировали из Курляндии и с других плацдармов 76 000 раненых, из которых около 3000 умерли на переходе морем. С 27 февраля эвакуации подлежали только тяжелораненые.
В протоколе совещания, проведенного у фюрера 21 марта, имелись указания о необходимости доставки войскам боеприпасов. Всего планировалось к доставке 1960 тонн в Пиллау и 454 — в Готенхафен, куда в последующем предполагалось перевезти еще 233 тонны. 1 апреля в главной квартире фюрера было выражено мнение, что к числу причин, вызвавших отступление германских войск в районе Данцига, можно было отнести плохое снабжение войск боеприпасами и недостаточную огневую поддержку войск кораблями 2-й боевой группы.
10 апреля Гитлер высказывал сомнение относительно возможности дальнейшего сопротивления в районе Хеля и 15 апреля приказал командующему ВМС в течение 6 дней перебросить 7-ю танковую дивизию с Хеля в Свинемюнде.
Между 21 марта и 10 апреля флот эвакуировал с востока на запад 157 270 раненых. После гибели парохода «Гойя», по данным, которые были сообщены на совещании у фюрера 18 апреля, потери составили всего лишь 0,49 %.
Из Пиллау с 25 января морем эвакуировалось около 450 000 беженцев и кроме того, на косу Фриш-Нерунг было перевезено еще 200 000 человек. Из района, обороняемого 4-й армией, по льду и судами через залив Фриш-Хаф на косу перешло приблизительно 450 000 человек.
С косы Фриш-Нерунг и из района устья Вислы до 3 мая эвакуировалось 265 000 человек и еще 14 000 эвакуировали с 3 по 6 мая. Перед самой капитуляцией — еще 21 000 беженцев и раненых.
Из Оксхефта на Хель 25 марта доставили 35 000 и в начале апреля — 40 000 человек. Всего из портов Данцигской бухты и Хеля удалось перевезти на запад 900 000 беженцев. Из Кольберга перевезли 70 000 человек, а из Свинемюнде и с Померанских островов — приблизительно 80 000. Всего в Данию и Северную Германию морским транспортом доставили 1 500 000 беженцев. Кроме того, 560 000 беженцев попытались эвакуироваться сухопутным транспортом и примерно 2 миллиона более или менее добровольно остались в Восточной и Западной Пруссии и Померании. При перевозке морем погибло менее 10 000 беженцев.
Кроме полутора миллионов беженцев, за последние 5 месяцев ВМФ перевез на запад около 300 000 раненых военнослужащих и приблизительно 700 000 солдат с плацдармов, многие из них, впрочем, попали в окружение на Хеле и в других районах, погибли или попали в плен к русским. Тем не менее потери на море составили менее 10 000 человек.
Временное снабжение и эвакуация с большинства плацдармов были возможны лишь благодаря господству Кригсмарине на море. При этом действия судов были затруднены недостатком горючего, минной опасностью и постоянными бомбардировками портов. Поскольку необходимо было еще осуществить переброску войск из Норвегии в Данию и ее охранение, а на востоке плацдармы множились, словно грибы после дождя, одновременно выполнить все задачи было уже невозможно. Потери промежуточных баз и необходимость в связи с наступлением советских войск проводить перебазирование дальше на запад увеличивали потребность в судах и кораблях.