В феврале 1980 г. в составе полка была сформирована эскадрилья из 20 экипажей, задачей которой было определено участие в боевых действиях в Афганистане. Ее командиром был назначен майор Ю.А. Варочкин. На аэродроме «Чирчик» летчики эскадрильи прошли ознакомительную горную подготовку. Там же эскадрилья из Нивенского вошла в состав формируемого, ставшего впоследствии знаменитым 50-го ОСАП. 9 марта 1980 г., совершив перелет по маршруту Чирчик – Каган – Кокайды – Кундуз, личный состав и техника прибыли к месту базирования. Первый боевой вылет эскадрилья совершила с аэродрома «Кундуз» 11 марта 1980 г. Вскоре эскадрилья перебазировалась на аэродром «Кабул». Затем на протяжении 9 лет через Афганистан, а именно через 2-ю и 3-ю вертолетные эскадрильи 50-го ОСАП прошли более 500 военнослужащих 288-го ОВП. Основными задачами вертолетчиков, действовавших преимущественно парами на Ми-24, были штурмовка укрепленных районов, огневая поддержка сухопутных войск, разведка, свободная охота, прикрытие транспортных вертолетов Ми-6 и Ми-8, обеспечение безопасности взлетов и посадок в аэропорту «Кабул», сопровождение колонн, а также поисково-спасательные и транспортные задачи. Работая днем и ночью, совершая за сутки до десяти боевых вылетов, экипажи работали практически по всей территории Афганистана. За период службы в Афганистане более 380 военнослужащих 288-го ОВП были удостоены государственных наград. Среди них четыре Героя Советского Союза: командир вертолетной эскадрильи 50-го ОСАП подполковник В.Н. Очиров (Указ от 21 февраля 1985 г.), подполковник Н.И. Ковалев (посмертно, Указ от 5 февраля 1986 г.), капитан С.В. Филипченков (Указ от 31 июня 1986 г.) и командир 50-го ОСАП полковник А.С. Голованов (посмертно, Указ от 16 июня 1989 г.). Всего за период командировок в Афганистан потери личного состава 288-го ОВП составили 18 человек.
В мае 1986 г. группа из 11 человек летного и инженерно-технического состава полка во главе с командиром вертолетной эскадрильи подполковником А.Н. Борисовым была направлена на ликвидацию последствий аварии на Чернобыльской АЭС. В ходе двухмесячной командировки эта группа налетала около 800 ч, практически ежедневно выполняя задачи радиационной разведки непосредственно над разрушенным реактором. По итогам выполнения поставленных задач в условиях радиоактивного заражения все офицеры группы были удостоены государственных наград.
С окончанием войны в Афганистане не прекратились командировки личного состава полка в «горячие точки». С 1980 г. и по нынешний день летчики, инженеры и техники задействуются в проведении миротворческих операций по линии ООН, а также в качестве военных советников в странах Африки, Южной Америки, Ближнего Востока и Юго-Восточной Азии, принимая участие в боевых действиях в различных локальных конфликтах. В 1995 г. офицеры боевого управления полка выполняли боевые задачи на территории Чеченской Республики. За проявленное мужество и самоотверженность в ходе первой чеченской кампании все они были удостоены государственных наград.
Одновременно продолжалась боевая учеба полка на аэродроме «Нивенское». Постепенно обновлялся и вертолетный парк. В 1990 г. в 288-м ОВП насчитывалось уже 48 вертолетов Ми-24 и 20 Ми-8 различных модификаций. Однако вскоре процессы технического обновления в Вооруженных Силах практически повсеместно прекратились. Кроме того, западное направление перестало считаться столь напряженным и потенциально опасным, как прежде. Начался процесс сокращения. Полк перешел на двухэскадрильный штат и стал включать 1-ю эскадрилью вертолетов огневой поддержки Ми-24 и 2-ю эскадрилью транспортно-десантных вертолетов Ми-8. Согласно данным в иностранной печати, в начале 2000 г. в полку оставалось 20 вертолетов Ми-24 и 29 вертолетов Ми-8. В дальнейшем, по мере исчерпания ресурса, а также в ходе ротации техники между вертолетными частями парк еще более сократился. Сокращению количественного состава авиатехники «способствовали» реформирование и оргштатные мероприятия.