Торпедное вооружение. Его усилили за счет установки ещё одной пары четырехтрубных ТА типа 92 модели 1 в носовой части нового торпедного отделения. Систему быстрой перегрузки торпед сдвинули дальше в нос, а восемь запасных торпед защитили 25-мм плитами стали Дкжоль. Всего на борт крейсера могли теперь принимать 24 кислородные торпеды типа 93. Улучшили и приборы УТС, благодаря чему дальность эффективной атаки увеличилась до 30000 м с лишним. В добавок к визиру типа 93 и директорам типа 92 в ЦАП установили вычислительный прибор типа 93, а на топе треногой фок-мачты оборудовали пост УТС с директором типа 97 (им управлял торпедный офицер) и необходимыми устройствами связи. Этот пост сначала установили только на “Миоко”, а остальные крейсера смогли получить его только в начале 1941 года.
Прожекторное оборудование. Три оставшихся 110-см прожектора типа “SU” (кормовая пара и один по ДП) заменили двумя 110-см типа 92 (бок о бок между трубами), что довело их общее число до четырех с возможностью работы по два на борт. На платформе УЗО поставили два устройства управления прожекторами типа 96, с помощью которых можно было освещать не только надводные, но и воздушные цели. Авиационное оборудование. Установленные в 1935 году катапульты модели 3 заменили более мощными типа Куре №2 модели 5, способными запускать самолеты весом до 4000 кг со скоростью 28 м/с. Полностью модифицировали и рельсовую систему для перемещения самолетов, которая стала похожей на систему крейсеров типа “Могами”. Установили также более мощную грузовую стрелу, форма которой на “Миоко” несколько отличалась от других. Теперь крейсера этого типа могли принимать на борт новый 3-местный разведчик типа 0 и два новых 2-местных корректировщика типа 0: первый обычно хранился на катапульте правого борта, остальные - на катапульте левого борта и рельсах. Но из-за нехватки новых самолетов до ноября 1941 года “Асигара” нес три ГСМ типа 95, “Наги” и “Хагуро” - по одному типа 94 и по два типа 95. Затем все четыре крейсера несли по одному 3-местному типа 0 и по два типа 95. Четыре 250-кг и 44 60-кг бомбы хранились в специальном ангаре, а для подачи тяжелых бомб к самолетам имелся подъёмник.
Котлы. В котлах сменили трубки и установили новые форсунки, а 6 котлов снабдили подогревателями. Это вместе с улучшением вентиляции (повышена мощность вентиляторов и улучшены их шахты) позволило снизить расход топлива. Для облегчения обслуживания котлов их посты управления и телефонный пост всех КО снова модернизировали.
Турбины. Установленные во время первой модернизации и доставлявшие массу хлопот “индукционные” турбины сняли. Для крейсерского хода приняли новую систему, при которой пар от ТКХ (носовой турбоагрегат) поступал прямо на кормовые ТВД, так что на крейсерском ходу вращались все четыре вала, облегчая переход к более высоким скоростям.
Скорость и дальность плавания. Из-за дальнейшего роста водоизмещения ожидалось падение скорости - по оценкам до 33,3 уз. при 132000 л.с. Но “Миоко” во время пробегов между постами Укурудзима 31 марта 1941 года достиг 33,88 узла при мощности 132830 л.с. и водоизмещении 14984 т. Максимальный запас топлива уменьшился с 2472 т нефти до 2214 т, из которых 480 т переместили во внешние части прежних булей и в новые були. Сначала была надежда, что повышение экономичности котлов повысит дальность на 14-узловой скорости примерно до 8500 миль, несмотря на уменьшение запаса топлива и увеличение водоизмещения. Но в реальности пришлось удовлетвориться 7900. На испытаниях “Миоко” по расходу топлива радиус его действия определили как 7463 мили.
Электрооборудование. Общую мощность генераторов подняли с 735 до 1250 кВт благодаря установке более мощных и добавлению пятого вспомогательного дизель-генератора на уровне СП над КО №5 и №6.
1) Однодеревную фок-мачту заменили треногой с гониометром типа 93 на самой верхушке и гониометрическим постом на среднем уровне. На топе мачты (сначала на “Миоко”, затем на остальных) установили пост УТС.