27 июня 1931 г. приказом РВС СССР № 106 Морские силы Каспийского моря были переименованы в Каспийскую военную флотилию, Дальневосточная Краснознамённая военная флотилия — в Амурскую Краснознамённую военную флотилию, а Особый отряд судов р. Днепр — в Днепровскую военную флотилию.
В апреле 1932 г. было начато формирование Морских сил Дальнего Востока. В соответствии с Положением о Народном комиссариате обороны СССР, утверждённым советским правительством и приказом наркома обороны СССР № 9 от 11 января 1935 г., их переименовали в Тихоокеанский флот (в том же году, на основании тех же нормативных документов, Морские силы Балтийского моря были переименованы в Краснознамённый Балтийский флот, а Морские силы Чёрного моря — в Черноморский флот). Уже к 1939 г. ТОФ насчитывал в своём составе 100 надводных и подводных кораблей6.
1 июня 1933 г. была создана Северная военная флотилия, переименованная 11 мая 1937 г. в Северный флот.
В 1930-е гг. заметно была расширена сеть военно-морских училищ, преобразованных в 1939 г. в высшие.
Постепенно развивались и другие силы и рода РККФ. Так, ещё в 1925 г. на основании приказа от 11.07 № 724/146 РВС СССР передал Береговую оборону из РККА в состав флота. Первыми БО была подчинена на Балтийском и Чёрном морях соответственно РВС МСБМ и РВС МСЧМ. Были введены должности начальников береговой обороны — помощников начальников МС по береговой обороне.
Однако в скором времени БО передали из Управления ВМС в Военно-техническое управление, а затем в Военно-строительное управление Красной Армии. И только 27 марта 1930 г. с целью дальнейшего упорядочения вопросов строительства и снабжения приказом РВС СССР № 017 Береговая оборона на всех театрах во всех отношениях вновь была подчинена начальнику ВМС РККА.
А в начале лета 1931 г. произошла реструктуризация БО. На флотах вместо отдельных органов защиты берега были образованы так называемые укреплённые районы — УРы.
3 апреля 1931 г. РВС СССР признал необходимым создать на Черноморском флоте, в Севастополе училище береговой обороны с общей численностью переменного состава в 500 человек и ежегодным выпуском 120-150 командиров.
А 30 мая того же года Реввоенсовет утвердил первый «План строительства береговой обороны на 1931—1933 гг.».
Через шесть лет, 17 января 1937 г., в соответствии с приказом наркома обороны СССР № 06, были выделены из Инженерного управления РККА и переданы в УМС РККА части морского берегового строительства с созданием в Управлении соответствующего отдела7.
Сложнее было с Морской авиацией. Почти 20 лет ей пришлось находиться в составе ВВС Красной Армии. На этом следует остановиться поподробней.
Первое Управление Морской авиации появилось ещё в июле 1917 г. Но 20 декабря того же года приказом № 4 по армии и флоту его неожиданно объединили с сухопутной авиацией и подчинили Всероссийской коллегии по управлению Красным Воздушным Флотом.
Тем не менее борьба военных моряков за собственную авиацию не прекратилась. И, «на основании доклада Морского Генерального штаба от 27 апреля 1918 г. № 41 и во изменение приказа по армии и флоту за № 4 Управление морской авиации», было оставлено «в полном подчинении Комиссариата по морским дезам» (приказ по армии и флоту от 25.05.1018 г. № З)8.
Однако уже 18 декабря того же года, с образованием Реввоенсовета Республики, приказом № 394 вся структура РККФ претерпела очередную реорганизацию. Была упразднена Коллегия Народного комиссариата по морским делам и вместо неё в составе РВСР создали Морской отдел во главе с командующим МС Республики. Соответственно вместо УМА был образован Авиационный отдел, который, как ни странно, вошёл в Главное управление кораблестроения9.
К концу Гражданской войны, 25 марта 1920 г., согласно приказу РВСР № 447/78, всё авиационное, воздухоплавательное и гидроавиационное дело Республики было объединено под началом Главного управления Рабоче-Крестьянского Красного Воздушного Флота. Одновременно учредили должности помощника начальника ГУ РККВФ по гидроавиации, помощника начальника Воздухофлота Республики действующей армии и флота и помощников начальников военных округов и фронтов по гидроавиации. А приказом РВСР № 2449/478 от 10.11.1920 г. действующую морскую авиацию в оперативном отношении подчинили коморси Республики. Согласно этому же приказу, помощника начальника ГУ РККВФ по гидроавиации также оперативно подчинили коморси Республики, по указаниям которого тот руководил боевой деятельностью авиации, а начальников авиации морей, авиационных дивизионов и отрядов подчинили командующим флотами и флотилиями10.