Оставшиеся гардемарины и кадеты на форту Джебель-Кебир с 1921 года были переведены в лагерь Сфаят, но и здесь дни корпуса были уже сочтены. Сигнал «разойтись» прозвучал в Африке, в лагере Сфаят вблизи Бизерты 6 мая 1925 года. Был выпущен последний курс гардемарин, закрылись учебные классы, упаковано оборудование и инвентарь. Преподаватели и выпускники прощались, расходясь по пространствам бесконечной земли, последний островок русской жизни перестал существовать, и замерло время, снова сквозь раскаленный воздух полился громкий призыв муллы на минарете, и беспристрастно подул ветер с Сахары. За время существования корпуса, открытого в Севастополе 17 октября 1919 года, через его учебную программу прошло 394 воспитанника, из которых получили аттестаты 300 человек.
Итак, Бизертский Морской корпус — это последнее звено тех перипетий, через которые прошла знаменитая петровская «Навигацкая школа», созданная 14 января 1701 года. В храме-памятнике, воздвигнутом русскими белыми моряками в 1936 году в Бизерте, в 1950 году была сооружена мраморная доска, на которой были отображены имена всех кораблей, пришедших из Крыма в африканские воды на Рождество 1920 года. Флаг последнего командующего последней Русской эскадрой контр-адмирала М. А. Беренса хранится в музее ООРИФ в Нью-Йорке.
С 1924 года с признанием Францией Советской России, все русские корабли в Бизерте перешли в собственность метрополии. Бывший начальник штаба Русской эскадры контр-адмирал Александр Иванович Тихменев писал: «В далеком тунисском городке, в Северной Африке, где нашли себе приют остатки Российского Императорского Флота, не только у моряков, но и у всех Русских людей дрогнуло сердце, когда в 17 ч 25 мин. 29 октября 1924 года раздалась последняя команда „На Флаг и Гюйс“ и спустя одну минуту — „Флаг и Гюйс спустить“. Тихо спускались флаги с изображением креста Святого Андрея Первозванного, символ Флота, нет — символ былой, почти 250-летней славы и величия России».
В 1925 году в Тунисе оставалось уже не более 700 русских. Остальные разъехались по всему миру. Часть русской общины еще ранее перебралась в тунисскую столицу, где в снятом приблизительно в 1922 году доме № 60 на улице Зешегз было оборудовано помещение для церкви, получившей название Воскресения Христова. Туда привезли иконостас и церковную утварь с кораблей. Служил в ней о. Константин Михайловский, приютившийся вместе со своей семьей в том же доме. Корабельная церковь на «Георгии Победоносце», где до спуска Андреевского флага служил отец Иоаникий Полетаев, была перенесена в снятую русскими частную бизертскую квартиру на улице Апри, в одной из комнат которой проходили службы.
Вначале 1930-х годов корабли Русской эскадры, переданные французам, были отправлены ими на слом. Свидетели уничтожения русской морской славы в лице остатков военных кораблей в Бизерте бережно хранили память о беспримерном походе и обсуждали идею строительства мемориального храма в память об исчезнувшей эскадре. Для этого ревнителями русской морской истории в Бизерте был создан комитет, в состав которого вошли в качестве председателя адмирал Александр Михайлович Беренс, а в качестве его действительных членов — контр-адмирал Сергей Николаевич Ворожейкин, работавший в то время в должности бухгалтера в тунисской колониальной конторе, бывший командир посыльного судна «Якут», капитан 1-го ранга Георгий Фридрихович Гильдебрант, капитан 2-го ранга, а ныне инженер-строитель французской компании Иван Сергеевич Рыков, стяжавший себе славу руководителя десанта у Покровки в мае 1920 года и старший лейтенант Александр Сергеевич Манштейн, бывший командир эсминца «Жаркий». Мирно покоящийся на бизертском кладбище старший лейтенант был отцом поныне здравствующей и проживающей в Бизерте Анастасии Александровны Манштейн-Ширинской, попавшей на берега Туниса восьмилетней девочкой в 1920 году на борту миноносца «Жаркий».
В 1936 году комитетом было получено разрешение французских колониальных властей на строительство храма. На основании решения бизертинского муниципалитета в 1937 году в городе было начато строительство храма на пожертвования русских эмигрантов, закончившееся менее чем через год. На церемонию закладки храма комитетом были приглашены все высшие французские и тунисские власти, военные и гражданские, вся русская колония Туниса, а также последний командующий эскадрой контр-адмирал Беренс и другие командиры кораблей. Закладку совершил митрофорный протоиерей Константин Малиженовский. Место будущей церкви, строящейся во имя святого благоверного великого князя Александра Невского, было красиво убрано флагами, а около места будущего святого престола красовались два русских флага — Андреевский, морской, и национальный «триколор».