В начале 90-х гг. «Бордо», не обладая значительными финансовыми возможностями, не могло позволить себе иметь состав, подобный «Олимпику» или «Пари Сен-Жермену». Как следствие, уровень притязаний был скромнее. В предпоследнем туре жирондисты принимали «Мец» и в случае победы досрочно гарантировали себе путёвку в кубок УЕФА следующего сезона. К счастью, именно на этот матч пришлась одна из лучших игр Зидана в сезоне 1992/93 гг. Уже на 9-й минуте Зинедин со штрафного, назначенного в 25 метрах от ворот, точно посылает мяч в цель. Через 12 минут Дюгарри удваивает счёт, по сути дела, решив исход матча, окончательный итог которого, 2:1 в пользу «Бордо». По итогам сезона дебютант Первого дивизиона, заняв 4-е место, с ходу завоевал путёвку в Еврокубки. К слову, проделывавшим в 90-х гг. подобный трюк с возвращением в Первый дивизион именитым «Марселю» и «Сент-Этьену» достижение «Бордо» повторить не удавалось. Не менее удачным был сезон и для самого Зидана — не отличающийся снайперскими качествами игрок в первый же сезон в новой команде стал её лучшим бомбардиром в первенстве Франции, сумев забить 10 голов, хотя в следующих трёх сезонах он забивал только по 6 за год.
Сезон 1993/94 гг. «Бордо» уже начинало как один из претендентов на путёвки в кубок УЕФА или Кубок кубков. Самые смелые поклонники аквитанцев, конечно, мечтали о большем, но для большинства обозревателей чемпион должен был выйти из «Большой тройки» — «Марселя», «ПСЖ» и «Монако». Тем не менее, жирондисты лихо начали первенство. В первом же туре «Бордо» встретилось с будущим чемпионом Франции — «ПСЖ» и, благодаря голу Зидана со штрафного, добилось победы со счётом 1:0. Затем в так называемом Атлантическом дерби южане наносят поражение тогдашнему лидеру первенства «Нанту» — 2:0. В 7-ом туре жирондисты никак не могли прорвать оборону упёршегося аутсайдера из Тулузы. Наконец, на 56-ой минуте хозяева получают право на штрафной в 25 метрах от ворот тулузцев. К мячу подходит Зидан. Короткий разбег, мяч в сетке, плотина рухнула, а «Бордо» выходит на первое место.
18 сентября 1993 года, Зидан вместе со своей командой приезжает на очередной календарный матч в свой родной город Марсель играть против местного «Олимпика». И уже на первой минуте гости открывают счёт. Время шло, а именитым хозяевам никак не удавалось переломить ход игры. И тут на первый план выходит Зидан, но, увы, не на пользу своей команде. На 36-ой минуте, впервые в своей карьере он увидел перед собой красную карточку и вынужден был на глазах 38-ми тысячи зрителей покинуть поле. Оставшись вдесятером, жирондисты сопротивлялись, как могли, но, в конце концов, капитулировали, пропустив подряд три мяча. Проступок Зидана разбирался специальной комиссией, присудившей ему двухматчевую дисквалификацию. Надо сказать, что ещё во время одного из первых своих выступлений за дублирующий состав «Канн», в Монпелье, Зинедин ответил сопернику, жёстко блокировавшему его. Результат — удаление, трехматчевая дисквалификация и наказание, назначенное его тренером. Зидан должен был три недели подряд… убирать раздевалку команды! Однако, как оказалось, это была не последняя его красная карточка.
Сам Зидан объяснял случившееся так:
«Я ненавижу несправедливость и насилие. Я получаю множество ударов за игру. Я принимаю их, ничего не говоря, но однажды приходит момент, когда я не могу более сдержаться. Я восстаю и взрываюсь. Это сильнее меня… Я выходец из неблагополучного района в Марселе. Здесь обычно не смакуют драки, но если кто-то провоцирует тебя, ты обычно не даёшь ему уйти от возмездия».
Вынужденное отсутствие в баталиях внутреннего первенства Зидан компенсирует тем, что принимает самое активное участие в потрошении несчастного ирландского «Богемианса» — 5:0, в ответном матче 1/32 кубка УЕФА. На его счёту первый гол в этом матче, и он же — вообще его первый гол в Еврокубках, а также голевой пас на Веркрюисса, приведший ко второму голу.
В октябре Зидан вновь выходит в составе команды в чемпионате Франции, но, к его огорчению, «Бордо» это особенно не помогло, клуб настиг игровой спад. Как и в прошлом сезоне, «Бордо» опять теряет столь нужные очки в матчах с аутсайдерами и в 13-м туре позволяет обойти себя парижанам. К зимним каникулам не позволявший себе подобных срывов ультрарациональный «ПСЖ» опережал жирондистов уже на 6 очков (при двухочковой системе начисления за победу), и вопрос о чемпионской короне для «Бордо», по существу, был закрыт. Вроде бы ничего, ведь чемпионства от аквитанцев не ждали, а все же было как-то грустно.
Оставалась ещё отдушина в виде выступлений в Кубке УЕФА. В 1/8 финала предстояла встреча с немецким «Карлсруэ», ворота которого защищал будущий лучший голкипер мира Оливер Кан. Первый матч состоялся 23 ноября 1993 года, в Бордо, и именно в этот вечер вся Европа узнала об искусстве штрафных ударов в исполнении Зидана. Надо сказать, что матч проходил со значительным преимуществом хозяев, но мяч упорно не шёл в ворота: то чуть собьётся прицел, то Кан блестяще сыграет. И так продолжалось до 77-й минуты, когда реализация наказания за очередной фол была доверена Зидану. Итог — победный мяч! К слову, треть всех своих мячей в играх за «Бордо» Зинедин провёл именно со штрафных.
К сожалению, достигнутого преимущества не хватило: в ответном матче при счёте 0:1 у французов был удалён Пай, и во втором тайме немцы сумели додавить гостей. Счёт разгромный — 0:3. Год завершался на минорной ноте, но «Бордо» ещё успело блеснуть в схватке с набравшим обороты «Монако» — 1:0. Пресса отмечала блистательную игру всей команды, а Зидан попал в число особо отличившихся. В целом же год выдался для него весьма успешным, и 21-летний хавбек получает в качестве рождественского подарка первый свой большой индивидуальный приз. Традиционно подводящий итоги года еженедельник «France football» называет Зидана лучшим в категории «Открытие года». В стране, сборная которой всего месяц назад испытала жуткую трагедию последних секунд, закрывшую ей второй раз подряд дорогу на Чемпионат мира, это признание звучало многозначительным авансом на будущее…
Однако в начале нового, 1994-го года новоявленную звезду подстерегает непредвиденный спад — так плохо, как в эти холодные две недели конца января—начала февраля Зидан не играл за «Бордо» со дня прибытия в эту команду. Впрочем, в своеобразную яму попала вся команда: в четырех матчах, проведённых после зимних каникул, набрано всего лишь одно очко, и команда откатилась на 5-е место. Речь шла уже не о конкуренции лидеру, от него «Бордо» отставало уже на 11 очков, а хотя бы о попадании в «зону УЕФА».
В упорных весенних баталиях жирондисты сумели все же завоевать путёвку в Еврокубки следующего сезона, одолев шедших на 2-м и 3-м местах, «Марсель» — 1:0 и «Осер» — 2:0. В предпоследнем туре «Бордо» принимало «Лан». В случае победы хозяева гарантировали себе в итоговой таблице первенства места с 3-го по 5-е, а, значит, и путёвку в кубок УЕФА следующего сезона. Матч начался просто феерически с непрерывных атак жирондистов, и уже на 2-ой минуте им удалось открыть счёт. Дюгарри сумел отобрать мяч у соперника и сделать пас на Лизаразю, тот в свою очередь переправил мяч на Зидана, который и использовал свой шанс на все сто процентов. И в дальнейшем эта троица творила в атаке все, что хотела. Дюгарри сумел сделать дубль, Лизаразю — две голевые передачи и гол, а Зидан прекрасно дирижировал своими партнёрами, доведя матч до победы со счётом 4:2. Цель была достигнута, и на этом первенство для «Бордо» фактически завершилось.
Кроме игр внутренних соревнований (Чемпионат и Кубок Франции), в апреле Зинедин принимает участие в финальном турнире молодёжного чемпионата Европы 1994 года. Это был первый официальный турнир такой значимости для Зидана на уровне сборных, и получилось не так, чтобы очень. В полуфинальном матче со сборной Италии, несмотря на поддержку своих болельщиков, а игра проходила в Монпелье, французы не смогли в игровое время прорвать оборону соперников и проиграли в серии послематчевых пенальти.
Несмотря на этот прокол, в целом игра Зидана весной 1994 года, получила довольно хорошие оценки, и, как результат, по итогам голосования среди игроков и тренеров Первого дивизиона Зинедин признан лучшим молодым игроком сезона 1993/94 гг.