Яков не пытался использовать народное восстание в Ирландии в своих реставраторских целях. Он, как и католическая знать, боялся народной борьбы и все надежды возлагал на помощь Людовика XIV. Свою армию он усилил 7-тысячным отрядом из Франции, прибывшим в обмен на ирландских солдат в количестве 5800 человек, отправленных н, а службу Людовику XIV. Однако в июне 1690 г. Вильгельм Оранский высадился с 36-тысячной армией в Каррикфергусе (Ольстер). Произошло сражение на реке Бойн. Армия Вильгельма состояла из закаленных в боях на континенте наемников, по количеству она превосходила противника в два раза и имела 40 тяжелых орудий, а Яков — только 12. Это решило исход сражения — якобиты были разбиты. Сам Яков предал восставших. Узнав, что армия Вильгельма переправилась через реку, он отдал приказ отступать и ускакал в Дублин, а оттуда в Уотерфорд, где погрузился на корабль и бежал навсегда во Францию.
Вильгельм вступил в Дублин и очень легко овладел Ольстером и Ленстером, а виконт Черчилль (впоследствии герцог Мальборо) в Манстере овладел Корком и Кинсайлом. Но войска католиков после бегства короля отошли за реку Шаннон и закрепились в городе Лимерик, удерживая в своих руках мост через Шаннон у Атлона. Среди командующих этими войсками выделялся своими радикальными взглядами и опытом англо-ирландец лорд Патрик Сэрсфилд, он умело руководил обороной Лимерика и не сдал его английским войскам. Сам Вильгельм после нескольких попыток не смог взять Лимерик, и вскоре ему пришлось возвратиться в Англию. События в Европе требовали от Вильгельма скорее закончить ирландскую кампанию и перебросить свои войска на континент. 3 октября 1691 г., через месяц после начала осады Лимерика, был подписан мирный договор, в котором католики в Ирландии добились почетной для себя капитуляции.
По Лимерикскому договору они соглашались сдать королевской армии город Лимерик и занятые ими территории в графствах Лимерик, Клер, Керри, Корк, Слайго и Мейн на условиях, которые излагались в 13 статьях договора. Всем католикам Ирландии гарантировались свобода вероисповедания и привилегии, которыми они пользовались при Карле II. Жителям Лимерика и других территорий, занятых ирландскими войсками, всем офицерам и солдатам армии Якова II, которые подчинились Вильгельму, гарантировалась собственность на их поместья, им возвращались права, титулы и привилегии, должности и занятия, которые они имели при Карле II, однако с условием принести королю Англии присягу верности, установленную английским парламентом в первый год царствования Вильгельма. Особой статьей оговаривалось, что клятва для католиков должна быть только такой, «но не другой», что означало освобождение католиков от обязанности приносить не совместимую с их религией клятву признания церковной супрематии короля, — очень важная для католиков уступка. Католики получали прощение по всем обвинениям в государственной измене, выдвинутым правительством Вильгельма. Вместе с этим каждому аристократу и джентльмену-католику разрешалось иметь лошадь, меч, пистолеты и другое огнестрельное оружие, необходимое «для защиты или охоты»[268].
По существу, это был сговор за счет широких слоев ирландского народа. В Лимерикском договоре о крестьянах ничего не говорилось. Но под словом «защита», для которой этим землевладельцам разрешалось иметь в поместьях оружие, подразумевалась и защита от нападения крестьянских отрядов тори. Более того, католические лорды в Ирландии взамен тех прав, которые им предоставлялись договором в Лимерике, обязывались не только сохранять верность Вильгельму и поддерживать его власть над Ирландией, но и согласиться с массовой экспроприацией ирландских крестьян, осуществленной при земельном «устроении» Ирландии Кромвеля и Карла II.
С заключением Лимерикского договора закончился многовековой период английского завоевания Ирландии, принесший ирландскому народу неисчислимые бедствия и страдания, и начался период английского господства' над побежденной, по не смирившейся Ирландией.