Пораженный случившимся, Центральный Комитетъ предложилъ бывшимъ членамъ "Боевой Организацiи" продолжать боевое дѣло безъ Азева и Савинкова и въ результатѣ его старанiй въ этомъ направленiи, Зильбербергъ рѣшилъ организовать новую самостоятельную боевую дружину по типу и съ традицiями распавшейся "Боевой Организацiи" и получилъ на то разрѣшенiе Центральнаго Комитета. Ядро группы составили Ирина, Сулятицкiй, Кудрявцевъ и еще нѣсколько человѣкъ, а во главѣ ея сталъ Зильбербергъ, который велъ и сношенiя дружины съ Центральнымъ Комитетомъ. Дружина была названа "Боевымъ отрядомъ при Центральномъ Комитетѣ".
Отрядъ долженъ былъ получать на каждое предпрiятiе разрѣшенiе отъ Центральнаго Комитета. Вскорѣ послѣднiй поручилъ ему организовать покушенiе на предсѣдателя Совѣта Министровъ Столыпина, министра внутреннихъ дѣлъ Дурново, свиты генерала Орлова и петроградскаго градоначальника Лауница. Въ то же время Центральный Комитетъ поручилъ отряду начать собирать свѣдѣнiя для подготовки покушенiя на Государя Императора и Великаго Князя Николая Николаевича.
Въ Ноябрѣ въ составъ отряда вошли еще нѣсколько человѣкъ и въ томъ числѣ Никитенко и Синявскiй. Отрядъ началъ подготовительныя работы и велъ ихъ путемъ наружнаго наблюденiя за выѣздами интересовавшихъ его лицъ и путемъ внутренняго освѣщенiя распорядка ихъ жизни. Послѣднее требовало широкихъ знакомствъ во всѣхъ слояхъ общества, чего отрядъ, располагая хорошими денежными средствами и умными предпрiимчивыми исполнителями, и достигъ.
Вотъ какъ описываетъ систему работы, которой сталъ придерживаться отрядъ Зильберберга, членъ отряда Ирина. "Организацiя производитъ свои розыски съ двухъ сторонъ: "внѣшнiй сыскъ" — уличная слѣжка при помощи извозчиковъ, разносчиковъ, филеровъ сохраняется, но на первый планъ, какъ основа, выдвигается "внутреннiй сыскъ" — полученiе свѣдѣнiй. Отыскиваются люди въ обществѣ и въ партiи, могущiе дать какое-либо указанiе, какiе-либо свѣдѣнiя о намѣченныхъ лицахъ. Наружная слѣжка провѣряетъ ихъ данныя. Всѣ партiйныя организацiи должны давать въ распоряженiе "Боевого отряда" любого изъ своихъ членовъ, если онъ имѣетъ какiе-либо связи, могущiя быть полезными въ дѣлѣ этого внутренняго сыска. Оосбенно много давали члены военной и желѣзнодорожной организацiй и телеграфисты. Такимъ образомъ, основанiе, на которомъ организацiя утверждала свое зданiе, расползалось далеко вширь. Работа получала въ значительной мѣрѣ случайный характеръ — въ зависимости отъ тѣхъ свѣдѣнiй, которыя получались. Нельзя было составить одинъ планъ и долго и упорно добиваться его осуществленiя. Самое существованiе такого плана становилось невозможнымъ: случайность, измѣнчивость, текучесть формъ работы и организацiи выдвинулись впередъ"…[26]
Наибольшiя усилiя отряда были направлены на министра Столыпина и Великаго Князя Николая Николаевича, но разныя непредвидѣнныя обстоятельства разстраивали планы отряда. Покушенiя, какъ на указанныхъ, такъ и на другихъ намѣченныхъ отрядомъ лицъ, не сорганизовывались. Наконецъ въ Декабрѣ отряду удалось достать билеты на освященiе домовой церкви въ зданiи Института экспериментальной медицины въ Петроградѣ. По свѣдѣнiямъ, добытымъ отрядомъ, на освященiи должны были присутствовать Столыпинъ и Лауницъ. Съ цѣлью покушенiя на нихъ Зильбербергъ назначилъ Кудрявцева и Сулятицкаго.
21 Декабря Кудрявцевъ, прiехавъ на освященiе церкви, послѣ богослуженiя, на лѣстницѣ, убилъ тремя выстрѣлами градоначальника Лауница, послѣ чего выстрѣлилъ себѣ въ високъ. Въ тотъ же моментъ онъ получилъ смертельные удары по головѣ шашкой отъ одного изъ стоявшихъ около него офицеровъ, и тогда же въ него дважды выстрѣлилъ полицейскiй офицеръ. Бывшiй въ церкви Сулятицкiй, назначенный стрѣлять въ предсѣдателя Совѣта Министровъ Столыпина, въ виду неприбытiя послѣдняго, скрылся. Это было первое и послѣднее выступленiе отряда Зильберберга въ 1906 году; дальнѣйшая его работа относилась уже къ слѣдующему 1907 году.
Кромѣ описанныхъ центральныхъ боевыхъ организацiй, у партiи работали по террору летучiе отряды, сформированные почти у всѣхъ областныхъ организацiй, и мѣстныя боевыя дружины. Мѣстные комитеты вообще были настроены относительно террора болѣе рѣшительно, чѣмъ центръ. Даже тогда, когда Центральный Комитетъ дѣлалъ постановленiя хотя бы и объ условныхъ, временныхъ прiостановкахъ террора, многiе мѣстные комитеты не раздѣляли этого взгляда и шли въ своихъ дѣйствiяхъ наперекоръ ему. Въ дѣло осуществленiя террора комитеты старались внести какъ млжно болѣе системы и организацiи. Многiе выработали уставы для всякаго рода боевыхъ организацiй. Такъ были выработаны: "Уставъ городской милицiи", "Уставъ крестьянской боевой дружины", "Проектъ устава областной летучки", которые и были опубликованы Центральнымъ Комитетомъ, какъ образцы подобныхъ изданiй.
Въ дѣлѣ практическаго проведенiя террора первое мѣсто принадлежало Сѣверной и Поволжской областямъ.
Въ Сѣверной области летучимъ отрядомъ, 13 августа, на платформѣ станцiи Новый Петергофъ былъ убитъ командиръ лейбъ-гвардiи Семеновскаго полка генералъ Минъ. Въ генерала стрѣляла упоминавшаяся уже не разъ Коноплянникова, имѣвшая при себѣ, кромѣ револьвера, еще и бомбу въ сумочкѣ. 2 декабря два члена отряда, рабочiе Воробьевъ и Березинъ, совершили покушенiе въ Таврическомъ саду на бывшаго московскаго генералъ-губернатора Дубасова, при чемъ послѣднiй былъ контуженъ одною изъ двухъ брошенныхъ въ него бомбъ, а покушавшiеся арестованы. 26 декабря членъ отряда, бывшiй матросъ Егоровъ, руководитель кронштадтскихъ безпорядковъ, переодѣвшись въ форму писаря военнаго суда, проникъ въ садъ, гдѣ гулялъ главный военный прокуроръ генералъ Павловъ, и нѣсколькими выстрѣлами убилъ его.
Дѣятельность боевыхъ дружинъ Петроградскаго комитета партiи не могла развиться въ желаемой для революцiонеровъ степени, вслѣдствiе систематически наносившихся ей ударовъ. 8 января была арестована группа боевиковъ во главѣ съ нелегальнымъ Мальцевымъ. 7 февраля были произведены многочисленные обыски лицъ, принадлежавшихъ къ боевой дружинѣ, при чемъ было обнаружено большое число револьверовъ, патроновъ, революцiонная литература, печать и штемпель комитета. 15 февраля у двухъ соцiалистовъ-революцiонеровъ были найдены двѣ бомбы, револьверъ и прокламацiи. 12 апрѣля были арестованы шесть представителей боевыхъ дружинъ съ главнымъ ихъ организаторомъ. 5 iюля была арестована сходка группы дружинниковъ въ 5 человѣкъ. 5 сентября арестованы 13 человѣкъ "Мѣстной боевой организацiи", изъ которыхъ 5 жили по фальшивымъ паспортамъ подъ чужими фамилiями. 20 сентября арестована группа членовъ (21 человѣкъ) "Боевого коллектива мѣстнаго комитета", который готовился совершить цѣлый рядъ террористическихъ актовъ. Обысками у нихъ обнаружено около трехъ пудовъ динамита, шесть динамитныхъ патроновъ, револьверы, партiйная литература. Шесть человѣкъ коллектива задержаны въ то время, какъ они поджидали на улицѣ, съ цѣлью ограбленiя (?) казначея штаба Отдѣльнаго корпуса пограничной стражи. Послѣднiй долженъ былъ вести изъ казначейства въ штабъ 25,000 рублей. При преслѣдованiи одинъ изъ боевиковъ былъ убитъ.
Въ виду того, что одинъ изъ главарей этого коллектива состоялъ въ Институтѣ инженеровъ путей сообщенiя и стоялъ во главѣ комиссiи, завѣдывавшей библiотекой, послѣдняя была обыскана. Въ библiотекѣ были обнаружены разныя революцiонныя изданiя, въ одномъ же изъ шкаповъ найдено 39 оболочекъ для македонскихъ бомбъ, большое количество пироксилиновыхъ шашекъ, четыре электрическихъ запала для бомбъ и около полутора пуда динамита.