Генетики объясняют сравнительную однородность домашних кошек в Европе и на Ближнем Востоке местной традицией держать этих животных на кораблях. К примеру, можно легко представить себе помёт котят, зачатых в Ливане и рождённых два месяца спустя в Марселе после того, как их мать спрыгнула с корабля в порту. Ходившие по морю финикийцы, греки и римляне распространяли кошек по побережью Средиземного моря. В генах французских кошек до сих пор присутствуют следы торгового маршрута из Средиземного моря вверх по реке Рона, а потом вниз по Сене до Ла-Манша.
Широкое присутствие в Северной Европе кошек с мутацией красного окраса говорит о том, что эти животные были популярны у викингов-завоевателей почти тысячу лет назад[63].
Первое свидетельство о появлении домашних кошек, у которых не было полосатого окраса, относится уже к началу эпохи христианства. В Ⅵ в. греки первыми описали чёрных и белых кошек, но мутация чёрного окраса, которая случается довольно регулярно, могла распространиться на домашнюю популяцию несколькими веками раньше. Многие кошки, являющиеся носителями данной мутации, на самом деле не чёрного цвета. Чёрный окрас шерсти обусловлен наследственной неспособностью вырабатывать обычный светлый цвет кончиков волосков, которые придают диким кошкам их коричневатый окрас. Технически этот ген называется «агути». В этом случае шерсть приобретает свой базовый чёрный оттенок, но при условии, что котёнок наследует две изменённые копии (мутации) гена — от матери и от отца. Если же он является носителем одной нормальной копии и одной мутировавшей, тогда нормальная копия будет доминантой, и его шерсть приобретёт привычный полосатый рисунок. Таким образом, уже подросшие котята — полосатые самец и самка — могут произвести не только полосатых, но и чёрных котят. В настоящее время мутация чёрного окраса распространена повсеместно, что даёт основание предполагать, что она появилась до того, как финикийцы и греки начали распространять домашних кошек по Европе.
Чёрные и белые кошки противоположны друг другу не только по цвету, они также отличаются историей взаимоотношений с человеком. Кошки бывают полностью белого цвета либо если они альбиносы, и тогда у них розовые глаза, либо если они являются носителями мутации, когда «белый ген» доминирует. И те, и другие отличаются менее крепким здоровьем по сравнению с обычными кошками: они не только больше подвержены раку кожи — голубоглазые коты с доминирующим белым часто бывают глухими. Но самое главное, пожалуй, то, что в отличие от своих полосатых собратьев, полностью белые кошки выделяются почти на любом фоне, а значит, им будет непросто раздобыть себе пропитание. Если не считать породистую популяцию, в которой доминирующие белые окрасы специально разводились в отдельные породы, полностью белые кошки встречаются крайне редко и составляют не более 3 % особей, живущих в естественных условиях.
И, напротив, мутация чёрного окраса является настолько распространенной, что она не наносит заметного биологического ущерба её носителям. В некоторых регионах носителями данной мутации могут быть более 80 % кошек. И при этом не обязательно все или даже большинство этих животных имеет чёрный окрас, так как многие из них имеют только одну мутировавшую копию и, соответственно, получаются полосатыми. Сегодня чёрный окрас чаще всего встречается в Англии и Ирландии, в Утрехте в Нидерландах, в городе Чанг Май на севере Таиланда, в нескольких американских городах, таких как Дентон, штат Техас (насчитывающий в настоящее время рекордные 90 %), в Ванкувере, а также в Марокко.
Так как чёрный цвет был не всегда и не всеми любим, его повсеместность сложно объяснить. В силу того, что объяснения культурного характера не подходят, учёные подвели под распространение мутации чёрного окраса биологическую основу. Обладание данной мутацией, даже одной невидимой копией генов (гетерозигота), делает такого кота более дружелюбным по отношению к людям и/или другим котам. А это, в свою очередь, дает ему преимущество перед другими котами в условиях обитания в густонаселенных районах или же при вынужденном длительном контакте с людьми, например, на борту корабля[64].