Относительно небольшое сочинение «О явлении во плоти Бога Слова и против ариан» (с. 361–377) создано после 364 года. Оно содержит экзегезу некоторых мест Священного Писания, с помощью которых ариане стремились подтвердить свое учение о тварности Сына Божиего, в особенности тех фрагментов, где говорится о человечестве Господа Иисуса Христа и добровольном умалении («истощании») Сына Божиего через Воплощение. Данное произведение – это блестящее краткое изложение церковного учения о Христе в контексте антиарианской полемики и «сквозь призму» библейского богословия. Здесь разбираются такие темы, как божество Христа как Сына Божия, Его Воплощение (здесь мы также можем встретить наименование Пресвятой Девы Богородицей (с. 365), что было в особенности характерно для александрийской церковной традиции) и цели его: обожение человека, самоумаление Сына (вопрос о Его человечестве, страданиях, неведении и др., однозначно решаемый в пользу божества), вопрос о природе Святого Духа, Который дарует нам причастие Богу и обожение в Церкви через ее Таинства и др.
Завершается второй раздел историко-богословским трактатом «О Дионисии, епископе Александрийском, а именно, что он, как и Никейский Собор, думает противно арианской ереси». Произведение написано в 350–354 годах. В нем внимательно разбираются некоторые неоднозначные высказывания свт. Дионисия, епископа Александрийского († 265), которые тот употребил в полемике против савеллиан, лишавших Лиц Святой Троицы Их ипостасного существования и «сливавших» Их в одно Лицо. Св. Дионисий особенно стремился сделать акцент на отличии Сына Божия от Бога Отца. Такое отличие он находил не только в личной особенности Сына в Его рождении от Отца, но также и в Воплощении Сына, то есть указывал и на человечество Христа. И когда православные современники св. Дионисия (в том числе его тезка свт. Дионисий Римский) указали на его странные высказывания о тварности Сына, то свт. Дионисий развеял все сомнения и показал свою православность в этом вопросе. Но ариане данные выражения свт. Дионисия хотели использовать в своих целях, отнести их к Сыну Божию вне зависимости от Воплощения, стремясь показать, что и такой славный отец Церкви думал подобно им, что Сын есть творение. И «так как св. Дионисий писал в защиту себя именно против такого понимания его слов некоторыми христианами, какое усваивали ему ариане, то св. Афанасий в своем послании приводит значительные выписки из этих сочинений, опровергая ссылки ариан и показывая, что Дионисий мыслил о Сыне Божием вполне православно и был совершенно чужд арианских мнений»,[14] причем делает это убедительно и искренне, показывая истинные богословские мотивы таких выражений. Свт. Афанасий, с одной стороны, дает нам понять, что отдельные высказывания святых, к тому же будучи вырванными из контекста, не являются истиной в последней инстанции и подлежат внимательному исследованию прежде всего с точки зрения целостного Предания Церкви, с другой стороны, он «полагает предел» возможным разночтениям и четко дает понять, что, несмотря на возможную неудачность некоторых высказываний, святые отцы, и в том числе свт. Дионисий, не могут быть еретиками (подобно арианам и другим), и когда святым указывали на их ошибки в выражениях, они тут же смиренно стремились исправиться (в отличие от еретиков). Важное место в данном сочинении занимает тема тварных образов Святой Троицы и проблема их правильного истолкования.
Третий раздел составляют Творения историко-полемические. Они содержат в себе уже не столько богословское «измерение» борьбы против ереси ариан, сколько церковно-административное, церковно-историческое: описание и обличение различных интриг и злодеяний этих еретиков, причем «в лицах» – как принадлежащих церковной иерархии, так и из числа государственных чиновников. Особое место занимает отношение свт. Афансия к покровителю арианства императору Констанцию (правил в 337–361 годах). От сочинения к сочинению оно меняется: сначала доброжелательное (подобающее сану императора), святитель оправдывает Констанция как своего рода жертву интриг ариан; потом сам оправдывается перед императором, отвергая чудовищные обвинения еретиков в свой адрес, еретиков, к чьим мнениям оказался столь восприимчив Констанций; и, наконец, свт. Афанасий подвергает критике самого императора как еретика и даже сравнивает его с антихристом. К святому же императору Константину, отцу Констанция, свт. Афанасий хранит по-прежнему доброе чувство, даже несмотря на то, что именно Константин Великий отправил свт. Афанасия в первую ссылку (335–337 годы) в результате арианских интриг.